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中国科学: 生命科学 2011 年 第41 卷 第3 期: 173 ~ 177
SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS
评述
基于抗体的水稻蛋白质组学——开端与展望
① ② ② ③
刘国振 , 刘斯奇 , 吴琳 , 徐宁志
① 河北农业大学生命科学学院, 保定 071001;
② 中国科学院北京基因组研究所, 北京 101318;
③ 中国医学科学院肿瘤研究所, 北京 100021
E-mail: gzhliu@
收稿日期: 2010-12-17; 接受日期: 2011-03-07
国家自然科学基金(批准号:和国家重点基础研究发展计划(批准号: 2007CB109201)资助项目
doi: 10.1360/052010-760
摘要 为了深入开展水稻基因功能研究, 借鉴人类蛋白质研究中的相关理 关键词
念, 提出了基于抗体的水稻蛋白质组学的策略. AbRP 的要点在于, 建立针对水 基于抗体的水稻蛋白质组学
水稻
稻蛋白质的抗体资源库, 利用大规模免疫分析技术, 揭示水稻蛋白质在不同时
抗体
空条件下的表达状态并了解其相关功能. 用 AbRP 策略可以对特定的基因家族
免疫印迹
或途径相关蛋白质进行研究, 可以检测蛋白质的表达量及修饰的变化等. AbRP
的实施将为水稻基础和应用研究创建一个重要的支撑平台, 基于抗体的蛋白质
表达数据与基因组、转录组数据相整合, 可望进一步丰富水稻乃至其他植物研究
的公共数据资源.
水稻是最重要的粮食作物之一, 也是基础研究 (antibody-based Proteomics, AbP) 已经为蛋白质组分
的模式植物. 近年来, 水稻基因组学研究获得了极 析奠定了一条新的方向. 为了推动水稻蛋白质组学
大的发展, 包括不同亚种在内的多个水稻品种的全 研究的开展, 借鉴 AbP 的相关理念, 结合自身的工作,
基因组测序已经完成[1~3], 基因组学的成果为转录 提出了基于抗体的水稻蛋白质组学(antibody-based
组学[4] 、蛋白质组学及功能基因组学的发展奠定了重 rice proteomics, AbRP) 的研究策略. 旨在向广大同行
要的基础. 在水稻蛋白质组学研究中, 利用双向电 介绍 AbRP 的基本设想, 以期对AbRP 的研究日趋完
泳、多维液相色谱与质谱结合的技术, 分析了水稻不 善并具有可操作性.
同生理条件下的蛋白质表达, 获得了许多与重要生
物学过程相关的蛋白[5~8]. 蛋白质是生物功能的主要
1 概念的提出
执行者, 毫无疑问, 系统的蛋白质组学研究将在植物
基础和应用研究中扮演越来越重要的角色. 然而, 从 采用多种抗体, 通过大规模免疫检测的方法, 分
技术层面上而言, 蛋白质组分析仅仅依赖电泳、色谱 析组织或细胞内不同蛋白质在不同生理、时空条件下
和质谱的策略是远远不够的. 事实上, 在人类蛋白质 的存在状态并揭示其功能, 这一策略就称为“基于抗
组学研究计划中 , 基于抗体的蛋白质组学策略
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