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DNA指纹图谱实验
上课地点:生化楼上课时间:任课教师:办公地点:生化楼 电话:847063
课程要求:
预习掌握实验目的及原理、仪器和试剂、实验步骤实验注意事项:
1、实验台要求摆放整齐;
2、;
3、实验纪律:
1、按时上课
2、穿实验服(白大衣)
3、不许吃东西,大声喧哗
4、手机静音
实验成绩:
预习报告: 20分
实验操作: 40分
报告内容:结果和讨论 40分
DNA指纹图谱实验
(指导教师:薛闯)
一.实验目的
1. 掌握 DNA 指纹图谱技术的概念、原理和基本操作过程
2. 掌握琼脂糖凝胶电泳的基本操作技术,学习利用琼脂糖凝胶电泳测定 DNA 片段的长度。
3. 掌握对DNA指纹数据进行基本统计分析方法。?
二 . DNA指纹图谱实验原理
1984 年英国莱斯特大学的遗传学家 Jefferys 及其合作者首次将分离的人源小卫星 DNA 用作基因探针,同人体核 DNA 的酶切片段杂交,获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹,这种图纹极少有两个人完全相同,故称为 DNA指纹,意思是它同人的指纹一样是每个人所特有的。DNA指纹的图像在X光胶片中呈一系列条纹,很像商品上的条形码。由于 DNA 指纹图谱具有高度的变异性和稳定的遗传性,且仍按简单的孟德尔方式遗传,成为目前最具吸引力的遗传标记。
DNA 指纹具有下述特点:?
1. 高度的特异性:研究表明,两个随机个体具有相同 DNA 图形的概率仅3×10-11?;如果同时用两种探针进行比较,两个个体完全相同的概率小于 5×10?-19?。全世界人口约 50 亿,即 5×109?。因此,除非是同卵双生子女,否则几乎不可能有两个人的 DNA 指纹的图形完全相同。?2. 稳定的遗传性:DNA 是人的遗传物质,其特征是由父母遗传的。分析发现, DNA指纹图谱中几乎每一条带纹都能在其双亲之一的图谱中找到,这种带纹符合经典的孟德尔遗传规律,即双方的特征平均传递 50 % 给子代。?3. 体细胞稳定性:即同一个人的不同组织如血液、肌肉、毛发、精液等产生的 DNA 指纹图形完全一致。
DNA 指纹图谱法的基本操作:
从生物样品中提取 DNA ( DNA 一般都有部分的降解),可运用 PCR 技术扩增出高可变位点(如 VNTR 系统,串联重复的小卫星 DNA 等)或者完整的基因组 DNA ,然后将扩增出的 DNA 酶切成 DNA 片断,经琼脂糖凝胶电泳,按分子量大小分离后,转移至尼龙滤膜上,然后将已标记的小卫星 DNA 探针与膜上具有互补碱基序列的 DNA 片段杂交,用放射自显影便可获得 DNA 指纹图谱。
DNA 指纹图谱法的基本操作示意图
琼脂糖凝胶电泳:
琼脂糖凝胶电泳是分离,鉴定和纯化DNA 片段的常规方法。利用低浓度的荧光嵌入染料-溴化乙锭进行染色,可确定DNA 在凝胶中的位置。如有必要,还可以从凝胶中回收DNA 条带,用于各种克隆操作。琼脂糖凝胶的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范围较广。用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长度为200bp至近50kbp 的DNA。长度100kb 或更大的DNA,可以通过电场方向呈周期性变化的脉冲电场凝胶电泳进行分离。
在基因工程的常规操作中,琼脂糖凝胶电泳应用最为广泛。它通常采用水平电泳装置,在强度和方向恒定的电场下进行电泳。DNA 分子在凝胶缓冲液(一般为碱性)中带负电荷,在电场中由负极向正极迁移。DNA分子迁移的速率受分子大小,构象。电场强度和方向,碱基组成,温度和嵌入染料等因素的影响。
DNA指纹数据处理:
DNA指纹图谱的共有带率(Band-sharing,简称BS)
BS=2NAB/(NA+NB)
式中:NA指个体A的条带数,NB为个体B的条带数,NAB指个体A和个体B共有的条带数。
平均等位基因频率(q)及最低平均杂合率(Ht)
q =l-(1-BS)1/2,Ht=l-q
式中BS为共有带率。
两个个体具有完全相同的DNA 指纹图谱的概率(P)
两个无关个体具有完全相同的DNA 指纹图谱的概率为:
P1 =(1-2BS+2BS2 )n/BS ;
两个同胞个体具有完全相同的DNA 指纹图谱的概率为:
P2 =[1-0.5q(1-q)2(4-q)]n/BS
式中:n 为个体的平均条带数,q 为平均等位基因频率。
三 . 实验材料和试剂?
DNA 样品:犯罪现场CS DNA 样品、嫌疑犯S1 DNA 样品、嫌疑犯S2 DNA 样品、嫌疑犯 S3 DNA 样品
2. 化学试剂和溶液
(1). TAE( 50 ×)
Tris?242g
冰醋酸 57.1ml
ED
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