C14orf48基因在人精液精子中的表达和生物信息学分析.pdfVIP

中国实验诊断学 2011年6月 第 15卷 第6期 一 1041 一 文章编号：1007—4287(2011)06—1041—03 C14orf48基因在人精液精子中 的表达和生物信息学分析 李如凯 ，郭龙华 (1．深圳市石岩人民医院检验科 ，广东 深圳518036；2．广东省中医院检验科，广东 广州510120) 摘要：目的 筛选与弱精子症发生相关的基因。方法 采集正常男性和弱精患者精液精子，非连续梯度离心法 分离纯化精子，收集 95％percoll以下和57％与76％PercoH层之间的精子，以排除生精细胞和白细胞的污染。将纯化 后精子的cDNA探针与Aff3anetfix全基因组芯片杂交。筛选出差异表达的基因，利用生物信息学方法对该基因进行分 析。用RT-PCR验证该基因在正常男性和弱精患者精液精子中的差异表达，并用 RT-PCR方法分析该基因在人不同组 织(心、肝、脾、肺、。肾、胃、脑、睾丸)中的表达。结果 分析芯片杂交结果，筛选 出一个差异表达杂交点C14orf48 (GeneBank登录号BC031252)，该基因在正常男性和弱精子症患者精液精子中检测到的信号值均化后分别是 141．2(P) 和2．8(A)。生物信息学分析显示，该基因为全长 1952的完整ORF，编码 140个氨基酸、分子量为 15．808kD的功能未 知蛋白质Q8NCU1。该基因在人睾丸组织中特异性表达，亚细胞定位预测该基因在细胞质(39．1％)和细胞核(34．8％) 中表达。RT-PCR分析结果表明C14off48在弱精子症患者精液精子中不表达，在正常男性精液精子中强烈表达，在检 测人的8种组织中，也只有在睾丸组织中表达。结论 C14orf48基因为睾丸特异性表达基因，其在弱精子症患者精液 精子中不表达，提示其表达水平的缺失可能在弱精发中起着重要作用。 关键词：弱精子症 ；C14off48基因；基因芯片 中图分类号：R698 ．2 文献标识码 ：A ExpressionandbioinformaficsanalysisofC14orf48inejaculatedspermatozoafromnormozoaspermicandasthenozoospermic Il蜘 Ru-kai，GUOLong-hua．(1．Shiyanpeople’SHospital，Shenzhen518036，China；2．GuangdongProvinceHospitalofTradi— tiona!ChineseMedicine，Guangzhou510120，China) ． Abstract：Objective Toidentifygenesinvolvedinasthenozoospermia．Methods Semensampleswereobtainedfromnormo— zoospermicandasthenozoospemficvohmteersnadsemenanalysiswasperformedaccordingtoWHO criteria．Toruleoutthecontamina- ． tionofgemr ceHsandleucocytes，humanejaculatedspermatozoawerepurifiedbyadiscontinuousPercolldensitygradientcentrifuga— tion．CDNA samplesfrom purifiedspemr oftwogroupswereperfomr edwiht humna wholegenomeAffymetfixchipanalysistoscreen thedifferentlyexpressedgenes．Thecharacteristicsoftheselectedgenewereanalyzedbyvariousbioinformaticstoo