化学热力学在生命科学中应用研究.pdfVIP

第16卷第2期(2011) 甘音高．斥孑才巨 Vo1．16No．2(2011) 化学热力学在生命科学中的应用研究 卢新生 苟如虎 张海玲 刘伯渠 王亚玲 (甘肃民族师范学院 化学与生命科学系，甘肃合作 747000) 摘 要：综述 了热力学中熵和 自由能这两个重要状态函数在生命现象、肿瘤形成、抗癌药物研究、生物大分 子结构研究、药物设计、蛋白质工程和基因优化表达等中的应用． 关键词 ：熵；自由能；生命科学；熵增加原理 中图分类号：0642．1 文献标识码：A 文章编号：1008—9020(2011)02—057—04 热力学(thermodynamics)是研究各种形式的能量转换规 细胞向多细胞、从简单到复杂、从低级向高级进化，也就是说 律的科学．热力学的基础是热力学第一定律和热力学第二定 向着更为有序、更为精确的方向进化 ，这是一个熵减的方向， 律．因为热力学研究的能量转换规律是 自然界的一个基本规 与孤立系统向熵增大的方向恰好相反．但是生命体是 “耗散结 律．化学热力学是热力学原理在化学中的应用，它主要研究和 构”，耗散结构理论指出，系统从无序状态过渡到这种耗散结 解决化学变化过程中能量转化的规律 、化学反应的方向和限 构有几个必要条件：一是系统必须是开放的，即系统必须与 度．人体是一个巨大的化学反应库 ，生命过程是建立在化学反 外界进行物质 、能量的交换 ；二是系统必须是远离平衡状态 应基础之上的一个非常复杂的体系．近半个世纪以来，生物学 的，系统中物质、能量流和热力学力的关系是非线性的；三是 研究从整体开始，自上而下进入分子层次，而化学研究则 自 系统内部不同元素之间存在着非线性相互作用，并且需要不 下而上地逐渐接触生物体，化学与生命科学在细胞以下 、分 断输入能量来维持．2{1在平衡态和近平衡态 ，涨落是一种破坏 子以上的区域相遇，在这个区域不断生长出了许多新的生长 稳定有序的干扰 ，但在远离平衡态条件下 ，非线性作用使涨 点，成为生命科学和化学的前沿领域．基于热力学原理的生命 落放大而达到有序偏离平衡态的开放系统通过涨落，在越过 科学研究是一个新生长点，本研究综述如下． 临界点后 “自组织”成耗散结构，耗散结构由突变而涌现，其 1熵(entropy)与生命科学 状态是稳定的． 1．1熵与生命 耗散结构理论指出，开放系统在远离平衡状态的情况下 在化学热力学中熵是一个重要的状态函数．熵是系统混 可以涌现出新的结构．地球上的生命体都是远离平衡状态的 乱度的量度，系统的混乱度越大，熵值越大．熵变 (as)只取决 不平衡的开放系统，它们通过与外界不断地进行物质和能量 于体系的始态与终态，与过程无关．在孤立系统的任何 自发过 交换，经 自组织而形成一系列的有序结构．可以认为这就是解 程中，系统的熵总是增加的，这是热力学第二定律的一种表 释生命过程的热力学现象和生物的进化的热力学理论基础 达，也称为熵增加原理．生物是一个开放系统，开放系的熵决 之一，在生物学，微生物细胞是典型的耗散结构． 定于系统内产生的熵、外部流入的熵及系统流向外部的熵的 下面考察大肠杆菌生长过程中熵的变化，为此我们利用 数量． 熵的计算公式S=klogeP．k是玻兹曼常数，P是微观态数，熵 S 比如，人体是一个开放系 ，其熵的改变由两部分之和决 的单位是焦 ／度或卡／度，可以证明熵 S和信息H只差一个常 定，一是机体 内产生的熵 diS，二是流入的熵 des．于是总熵变 因子 S=(kloge2)H，因此熵也可用比特来度量 ，两种的关系 化为ds=diS+deS．因为diS0，而deS取决于