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2011;31(4) 南方医科大学学报(J South Med Univ ) ·587 ·
·技术方法·
转基因番茄Zeneca B,Da,F 实时荧光定量PCR 检测体系的建立
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麦荣嘉 ,陈敏芳 ,莫倩珍 ,胡良勇 ,黎事伦 ,唐敏然 ,顾晓敏 ,蔡永洪 ,周伦彬 ,周晓红
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南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物学系,广东 广州 510515 ;广州市计量检测技术研究院,
广东 广州 510030
摘要:目的构建转基因番茄Zeneca B,Da,F 品系的质粒标准分子及其实时荧光定量PCR(qPCR)检测体系。方法 基于反
向遗传学原理构建分别含有番茄内标准基因apx检测序列(ERG-apx),转基因番茄B,Da,F 品系pg基因的基因特异性序列
(GS-pg)及其构建特异性序列(CS-16S、CS-16A)的番茄内参质粒标准分子pEasy-T3-APX ,转基因番茄B,Da,F 品系的构
建特异性质粒标准分子pEasy -T3- 16A、pEasy-T3-16S;以Beacon Designer 7.5设计用于定性PCR 和qPCR 检测的引物对
和Taqman 探针;基于质粒标准分子建立了定性PCR 和qPCR 检测体系,对方法的特异性、敏感性、重复性、检测下限等指
标进行评估;使用PicoGreen 试剂盒对质粒标准分子进行定量,以质粒pEasy-T3- APX 为背景DNA 定量混有
pEasy-T3-16A 或pEasy-T3-16S制备成含量为1%和0.1% (w/w)的两组核酸标准物质,进行所构建qPCR 检测体系的定量
性能评价。结果锚定qPCR 检测靶序列:ERG-apx 108 bp, GS-pg 108 bp ,CS-16S 109 bp、CS-16A 102 bp ;酶切鉴定所构
建的质粒标准分子均可得到预期大小的插入子片段;所建立的实时荧光定量PCR(qPCR)检测体系,重复性的相对标准差
2
(RSD)0.2%~1.5% ,检测下限25 copies ,标准曲线方程线性关系R 值在0.994~0.998 ,效率在93.3%~102.4%。经换算系数
Cf 换算,对PicoGreen 定量的样品进行验证,其实测值与真值的偏差是-9.7%~17.3%。结论成功构建了转基因番茄Zene-
ca B,Da,F 品系的质粒标准分子及其qPCR 检测体系,为转基因番茄Zeneca B,Da,F 品系转基因成分的监测建立了可行的
可供使用的定性与定量检测体系。
关键词:质粒标准分子;转基因番茄;核酸检测技术;荧光定量PCR
中图分类号:Q78 文献标志码:A 文章编号:1673-4254(2011)04-0587-07
Construction of quantitative real-time PCR detection system of transgenic tomato line
Zeneca B,Da,F
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