雄激素非依赖性前列腺癌细胞中差异甲基化基因的初步筛选.pdfVIP

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2017-09-10 发布于重庆
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雄激素非依赖性前列腺癌细胞中差异甲基化基因的初步筛选.pdf

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中国细胞生物学学报 Chinese Journal of Cell Biology 2013, 35(1): 24–29 http ://www.cj 雄激素非依赖性前列腺癌细胞中差异甲基化基因的初步筛选 , 1 1 1 12* 秦婷婷　许　刚　季丽丽　陶志华 1 ( 温州医学院温州附属第一医院实验诊断中心, 温州325000; 2浙江大学医学院附属第二医院临床检验中心, 杭州310009) 摘要应用全基因组DNA 甲基化芯片(Illumina Infinium HumanMethylation27 BeadChip)杂交技术以及转录组RNA测序技术, 检测了雄激素依赖性前列腺癌(androgen-dependent prostate cancer, ADPC) 细胞株LNCaP和雄激素非依赖性前列腺癌(androgen-independent prostate cancer, AIPC)细胞株LNCaP-AI(androgen independent) 中的差异甲基化基因。发现与LNCaP 细胞株相比, LNCaP-AI 990 CpG 855 2 305 CpG 细胞株有个位点表现为高甲基化, 涉及个基因; 个位点表现为低甲基化, 涉及 1 970 mRNA 6 FAM111B RAB36 PCDH7 个基因。结合转录组表达结果, 筛选出个超甲基化基因: 、、、 COL6A2 IGF1R GULP1 8 EPHA3 TM4SF1 IGFBP5 FAM105A RASD1 、、 ; 个低甲基化基因: 、、、、、 ITPR2 CYP27B1 UBE2E3 Wnt 、、。这些差异甲基化基因涉及钙离子信号通路、信号通路等多个信号通路, 参与了细胞的基因表达、信号传导、细胞通讯、细胞运动、细胞黏附以及血管生成等功能, 为探讨这些差异甲基化基因在前列腺癌雄激素非依赖性转化过程中发挥的作用奠定了基础。关键词雄激素非依赖性前列腺癌; DNA 甲基化; DNA 甲基化芯片; 转录组测序 Preliminary Screening of Differentially Methylated Genes in Androgen- independent Prostate Cancer Cell Line