利用tuf,hsp60和pheS基因部分序列对乳杆菌进行分类研究.pdfVIP

利用tuf,hsp60和pheS基因部分序列对乳杆菌进行分类研究.pdf

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摘 要 本实验以我国内蒙古、新疆、青海、云南和西藏以及蒙古国地区牧民家庭以传统 方法酿制乳制品中分离出的乳杆菌为研究对象,采用测定hsp60基因、pheS基因和 a,f基因部分序列的方法对其进行分类研究。实验中根据不同采样地区,不同种属选 取了具有代表性的234株乳杆菌,先前的生理生化实验和16SrDNA测序实验已将其 部分序列,并测定其序列,再利用软件对序列进行分析比对确定其归属。 所有序列进行BLAST比对后利用DNAMAN软件计算菌株间同源性。结果表明, 92.2*/0-95.3%,88.1%一98.8%和97.4%-98.3%。Lcasei,L.helveticus和L plantarum 98.8%.100.O%。基于pheS基因L 99.1%.100.O%,99.1%.100.0%和99.3%.100.0%。 分类研究。进一步比较三种基因与先前测得的16SrDNA构建的发育树表明在亲缘关 系较近的乳杆菌分类鉴定中,hsp60基因、肋gS基因和tuf基因的区分能力明显优于 16SrDNA序列。 关键词:乳杆菌;16S rDNA;hsp60基因;肋PS基因;tuf基因:分类 onClassificationofLactobacillusBased Study Specieson颂 and GenePartial hsp60pheS Sequences Abstract were Alllactobacilliisolatedfromtraditionalhome-madefermented dairy samples —collectedin and ofChinaand Tibet,Qinghai,InnerMongoli毛YunnanXinjiang Mongolia. were classifiedandidentifiedinto and Lactobacilli L. preliminary L.plantarum、三.casei helveticusbiochemicaltestsand16SrDNA Lactobacilli by sequences.234representative werechosefromallisolatesbasedondifferentand werenamedL. regionsspecies,which and inthis casei L.heh,eticus plantarumgroup、Lgroup group ofisolateswere and andpheSgene amplifiedsequenced. totheNationalfor weresubmit

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