生物重演律下后生生物microRNA家族起源模型.pdfVIP

安徽农业科学，JournalofAnhuiA ．Sci．2013。41(12)：5213—5216，5226 责任编辑 朱琼琼 责任校对 卢瑶 生物重演律下后生生物 microRNA家族起源模型 闫凯 (南京大学，江苏南京210093) 摘要 生物重演律作为一个广泛传播的理论，在诸如动物分类学和发育生物学等生物进化研究上起着重要的指导作用。该理论指出： 生物在个体发育过程 中总是重演其所有祖先在进化过程 中的每个发育阶段 ，即生物的个体发育过程重演其祖先的系统发生过程。换句 话说，更高等有机体的继承和发展过程可从它的一些功能组织和器官中的祖细胞等。利用这个原理对微RNA(miRNA)的进化进行研 究，是利用分子生物学方法，如多序列比对等，所没有采用过的。文中利用从人类特定的组织和器官收集到的微 RNA表达数据为基础， 从微 RNA家族的角度进行整理并计算微RNA家族与组织的组织特异性，发现了某些特定组织和非组织特异性miRNA家族，并对这些 数据进行了进化分析，最后在生物重演律下引用各具有组织特异性的微RNA家族所对应的组织在解剖学上的起源描述了微RNA家族 整体的进化历史。 关键词 生物重演律 ；微 RNA家族 ；进化 中图分类号 S188 文献标识码 A 文章编号 0517—66l1(2013)12—05213—04 M etazoanmicroRNA FamilyOriginModelwithRecapitulationTheory YANKai (NanjingUniversity，Nanjing，Jiangsu210093) Abstract Therecapitulationtheory，asawidelydisseminatedtheory，playsavery importantroleinmacrobiologystudies，suchastaxonomy and evolutionarybiology． istheory meansthattheontogeneticprocessesofanorganism arefastandsimplesystemsdevelopedfrom processes inprogenitororganisms．Inshort，htehigherorganism inheritsanddevelopsprocessfrom itsprogenitors insomefunctionaltissuesandorgans． euseofthistheoryinthestudyofmiRNA evolution，usingmolecularmethodssuchasmultiplesequencealignment，hasnotbeenreported previously．Inthisarticle．wehavetakenan evolutionaryanalysisofmiRNAsfrom theperspectiveofmiRNA familyexpressiondatainhumna specifictissuesandorgans．Wediscoveredcertaintissue—specificandnon—tissue—specificmiRNAfamilies．andthesedataweresubjectedtoev— olutionaryanalysis．Atlast．wedescribedtheiroverallevolutionary historiesbyreferencingexistinganatomical daat ontlleoccurrenceandori— ginsofspecificorgansundertherecapitulationtheory． Keywords Recapitulationt}Ieory：miRNA family：Evolution 自1991年miRNA被发现以来，围绕其 已展开了许多诸 行研究。生物重演律 ，也被称为生物发生律 ，指 的是动物从 如功能、结构、预测和进化等方面的研究。基于miRNA结 胚胎发育到成熟个体的过程，是从原始的单细胞动物进化到 构、功能和调控网络的数据也有了大量积累并被广泛应用于 其生物学界元简单而快速的重演。更简单地说，这种理论是 建立像miRbase 这样的数据库上。研究表 明：在后生动物