黄瓜生长素响应因子CsARF10亚家族3个基因的克隆与表达分析.pdfVIP

园 艺 学 报 2013 ，40 （6 ）：1071 –1080 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 黄瓜生长素响应因子CsARF10 亚家族 3 个基因 的克隆与表达分析 * 郭勤卫，李 季，崔 利，张停林，Kere George Mbira ，陈劲枫 （南京农业大学园艺学院，葫芦科作物育种与种质创新实验室，南京 210095 ） 摘 要：利通过蛋白序列同源比对和 PCR 技术从黄瓜中克隆获得了 3 条生长素响应因子ARF10 基因 序列，分别命名为CsARF10a、CsARF10b 和 CsARF10c。系统发育进化树分析发现CsARF10a 与番茄SlARF10 基因进化距离较近，而 CsARF10b 和 CsARF10c 与拟南芥AtARF10 相似性更高；启动子分析显示 CsARF10 家族基因具有多样化的激素应答元件，荧光定量 PCR 结果也证明黄瓜幼苗在不同 NAA 浓度处理以及其 他激素的处理下，CsARF10 家族基因呈现不同的表达模式；荧光定量 PCR 结果还显示 CsARF10 家族基因 在黄瓜幼苗的根、茎、叶及雄花中都具有较高的转录水平；CsARF10a、b、c 在黄瓜果实发育的早期具有 相同的表达趋势，但 CsARF10a 的转录水平较高，而 CsARF10b 和 CsARF10c 表达量较低。 关键词：黄瓜；CsARF10；基因克隆；序列分析；表达分析 中图分类号：S 634.1 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2013 ）06-1071-10 Cloning and Expression Analysis of Cucumber CsARF10 Genes Subfamily * GUO Qin-wei，LI Ji ，CUI Li，ZHANG Ting-lin ，Kere George Mbira ，and CHEN Jin-feng （College of Horticulture，Laboratory of Cucurbit Genetics and Germplasm Enhancement ，Nanjing Agricultural University ， Nanjing 210095 ，China ） Abstract ：Three ARF10 genes （Auxin-Respond-Factor ）named CsARF10a，CsARF10b and CsARF10c， were screened from the cucumber genome database by protein homology BLAST and cloned from 8419s-1 by polymerase chain reaction （PCR ）. In present study，phylogenetic reconstruction indicated that the CsARF10a has closer relation with SlARF10 ，while CsARF10b and CsARF10c have higher similarity with AtARF10 . Promoter prediction showed that the promoters consist of diversified multiple hormone response elements. The real-time quantitative PCR （RT-qPCR ）analysis proved that the exp