蛋白质化学》总复习.ppt

《蛋白质化学》总复习 课程内容 第二章 蛋白质的合成、转运、加工与修饰 第三章 蛋白质的结构与功能 第四章 蛋白质的分离纯化 第五章 蛋白质定性定量检测 第六章 蛋白质的生物信息学 第七章 蛋白质组学理论与进展 第八章 蛋白质芯片理论与进展 第二章 蛋白质的合成、转运、加工与修饰 基本概念 SD序列/核糖体结合位点（RBS） 信号肽 分子伴侣 回答问题： 1．蛋白质在生物体内合成时所涉及的几个重要元素是什么？它们的结构特征及其在蛋白质生物合成中的作用如何？ 2．原核生物中蛋白质合成过程分哪几个阶段？对每个阶段的过程描述；每个阶段所涉及的辅助因子及其功能？ 3. 原核细胞与真核细胞的核糖体理化性质比较 4．蛋白质在细胞内跨膜位移过程中所涉及的重要元素有哪些？它们的结构特征及其在蛋白跨膜机制中的作用如何？（简述分泌性蛋白质跨膜移位的信号假说） 5．蛋白质合成后一级结构上和高级结构上的修饰有哪些？理解分子伴侣的概念及其在蛋白折叠中的作用。（蛋白质合成后的加工与修饰） 第二章 主要内容 1．蛋白质在生物体内合成时所涉及的几个重要元素 2．原核生物中蛋白质合成过程 3．蛋白质在细胞内跨膜位移过程 4. 蛋白质合成后的修饰 1．蛋白质在生物体内合成时所涉及的几个重要元素 （1）信使RNA（messenger RNA, mRNA） （2）遗传密码 （3）核糖体 （4）转运RNA（transfer RNA, tRNA） （1）信使RNA（messenger RNA, mRNA） SD序列/核糖体结合位点（RBS）：原核细胞mRNA的翻译起始密码子AUG的上游相距8～13个核苷酸处有一段由6～8个核苷酸组成的富含嘌呤的序列，以5’-AGGAGG-3’为核心，它与核糖体小亚基上的16S-rRNA 的近3’末端处的一段短序列互补。 （2）遗传密码 三联体密码（triplet code）/密码子（codon）：mRNA采用每三个相邻碱基编码一个氨基酸。 61个密码分别代表各种氨基酸（amino acid，aa）。一种aa少的只有1个密码（色氨酸和蛋氨酸），多的可有6个，但以2个和4个居多。 终止密码子：UAA、UGA和UAG。 起始密码子/蛋氨酸密码子：AUG（91％）/GUG（8％）。 遗传密码的特点：遗传密码的连续性、通用性、简并性、摆动性、不重叠性 （3）核糖体 核糖体上的4个活性部位： 受位/A位：氨酰基位点。即接受氨酰-tRNA的部位。 供位/P位：肽酰基位点。肽基-tRNA移交肽链后，tRNA被释放的部位。 肽基转移酶/转肽酶位：肽链合成过程中催化形成肽键的酶活性部位。 GTP酶位：可水解GTP，为催化肽基-tRNA由A位转到P位提供能量的酶活性部位。 核糖体的存在形式： 核糖体单体——无蛋白合成功能 多聚核糖体：与mRNA结合——具有蛋白合成功能 游离核糖体 结合核糖体（与内质网膜结合） 原核细胞与真核细胞的核糖体理化性质比较（见课件） （4）转运RNA（transfer RNA, tRNA） 特点：分子量较小，沉降系数约为4S，约占细胞中RNA总含量的10～15％，在蛋白质合成时起搬运氨基酸的作用。它对不同的氨基酸有特异性，一种tRNA只能搬运一种氨基酸。 与蛋白质合成有关的位点 氨基酸（aa）结合位点 反密码子位点 识别aa-tRNA合成酶的位点。 翻译过程中行使“起动”作用的tRNA：能特异地识别起始密码子AUG——蛋氨酰-tRNA（真核细胞）；甲酰蛋氨酰-tRNA（原核细胞或线粒体） 氨酰-tRNA合成酶的专一性： 对aa有极高的专一性，每种aa都有一个专一的酶。 只作用于L-氨基酸，不作用于D-氨基酸。 有的酶对aa的专一性并不很高，但对tRNA却有极高的专一性。 2．原核生物中蛋白质合成过程 （1）起始过程 （2）肽链延伸 （3）肽链合成的终止与释放 （4）原核生物中蛋白质合成过程所涉及的蛋白因子 （1）起始过程 ①大小亚基分开（在IF-3作用下）； ②mRNA与小亚基结合 ③形成30S起始复合物：在IF-2作用下，fMet-tRNAt与mRNA分子中的AUG相结合（在P位上），即密码子与反密码子配对，形成30S起始复合物） ④大小亚基结合，形成有生物学功能的70S起始复合物。 此时核糖体的Ｐ位被fMet-tRNA和ＡＵＧ占据；而A位则空着，有待于对应mRNA中第二个密码的相应氨基酰tRNA进入，从而进入延伸阶段。 （2）肽链延伸 ①进位：Tu-GTP与aa2- tRNA2结合成复合物；aa2- tRNA2与A位点上mRNA密码子结合；重新生成Tu-GTP。 ②肽键形成：在转肽酶作用下，形成肽键，成2肽；P位点上fMet与tRNA脱离；此时，P位空出。 ③移位：在移位酶(G)作用下，消耗1个GTP,核糖体沿mRNA