东平湖沉积物细菌多样性分析.pdfVIP

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2017-09-03 发布于安徽
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东平湖沉积物细菌多样性分析.pdf

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，， ■ 气▲ 1．1沉积物微生物多样性研究概述…………………………………………5 ■ 1．1．1沉积物环境特征………………………………………………………．5 1．1．2沉积物中微生物群落与环境因子间的相互作用……………………．6 1．1．3沉积物微生物生态学研究进展………………………………………。7 1．1．3．1沉积物中特定微生物群落分布的研究……………………………．．7 1．1．3．2沉积物环境中微生物群落结构组成…………………………………7 1．1．3．3沉积物宏基因组研究………………………………………………．．8 1．2细菌群落分析方法………………………………………………………．8 1．2．1环境基因组16SrDNA的PCR扩增…………………………………．9 1．2．216S rEINA文库………………………………………………………………………。11 1．2．3T．RFLP………………………………………………………………………………………．14 1．3生物群落多样性的测度………………………………………………．．16 1．3．1oc多样性的测度………………………………………………………．．16 1．3．1．1物种丰富度…………………………………………………………17 1．3．1．2物种相对多度模型…………………………………………………17 1．3．1．3物种多样性指数……………………………………………………．17 8 1．3．1．4物种均匀度指数……………………………………………………l k 1．3．2 p多样性的测度………………………………………………………。18 1．3．2．1二元属性数据测度法………………………………………………18 A 1．3．2．2数量数据测度法……………………………………………………19 1．4生物群落梯度分析……………………………………………………．．20 1．4．1直接梯度分析…………………………………………………………．2l 1．4．2间接梯度分析…………………………………………………………21 1．4．3约束直接梯度分析……………………………………………………．2l 1．4．3．1典型变量分析………………………………………………………．22 ⅡI 1．4．3．2典型相关分析………………………………………………………．22 1．4．3．3冗余分析……………………………………………………………．22 1．4．3．4典型对应分析………………………………………………………．22 1．5本文选题依据及研究意义……………………………………………．．22 2材料与方法………………………………………………………………．23 2．1生化试剂…………………………………………………………………．23 2．2仪器设备………………………………………………………………。24 2．3样品的采集……………………………………………………………．．24 2．4主要溶液的配制………………………………………………………．．25 2．4．1LB培养基……………………………………………………………．．25 2．4．2氨苄青霉素溶液…：…………………………………………………。25 2．4．3 X．Gal贮液………………………………………………………………………………25 2．4．4