PCR产物直接测序还是克隆测序密叶杉属rDNAITS序列的测定方法.pdfVIP

植物学通报 ， （）： !##! ?@ S SQ$ U R#P *#(+,), -.//,(+ %0 -%+1 #################################################### !!!!! 研究论文 ! !!!! !# 产物直接测序还是克隆测序？ ——— 密叶杉属$%’ ()* 序列的测定方法! 李春香 杨 群 （中国科学院南京地质古生物研究所 南京 !###$） 摘要 通过 产物直接测序和克隆测序对三种密叶杉属（ ）植物 内转录间隔区（ ）及 %’ !#$%’() ()*+ ,-. / 0$ . ()*+ 序列进行了测定与分析。实验表明! * )+,-(.%(/+) ()*+ 重复序列间的纯合程度很高，对 产物直接测序就可以测定其 区序列。而 、 的 重复序列间的纯合 %’ ,-. ! * ,’(0 %,( ! * 123 $+))%(/+) ,-. 程度较低，各重复单位间序列存在插入1 缺失，只有对%’ 产物进行克隆测序才能确定其序列。! * ,’(4 、 的 区尽管也存在多态性，但不同重复序列的浓度比较平均，对 产物直接测 0 %,( ! * 123 $+))%(/+) ,-.! %’ 序就可确定重复序列间的变异情况。本实验表明尽管是同一属的三种植物，但其()*+ 重复序列间的纯 合程度不同，同一植物 的不同区域，其重复序列间的纯合程度也不同，针对不同的 片段可采用不 ,-. ,-. 同的方法以测定其序列。 关键词 密叶杉属， ，协同进化， 产物直接测序， 产物克隆测序 ,-. %’ %’ %+$,-. *,/0,1-+12 34 !# !$350-.6 3$ *,/0,1-+12 78 931+12 !# !$350-.6—:,.;35 34 %,.,$+1+12 (1.,$1=9 )$=16-$+7,5 *=-,$ *,/0,1-,6 34 0-9,=$ #+7363=9 %’ +1 !#$%’() 2, ;+* =45 （ ， ， ） 5.6 (.- 7.)(2+ %0 8+%,%-9 : ;,+%.%,%-9 #+ =#(.+)+ !1/+9 %0 ?1(+.1+) *9585: !###$ ’76.$=-. -3? (?@4AB@ CD E8(?FB @?G4?5F85: CD %’ H(CE4FB@ C( @?G4?5F85: IJ FAC585: %’ H(CE4FB@ CD B3? 85B?(59A B(95@F(8I?E @H9F?(@ 95E B3? / 0 $. FCE85: (?:8C5 CD 54FA?9( (8IC@CK9A )*+ 85 !#$%4 ’() L?(? FCKH9(?E 95E 959AJM?E 0 -3? ()*+ (?H?9B 458B@ CD ! * )+,-(.%(/+) 39N? I??5 3CKC:?6 ，