应用多重巢式PCR法快速鉴定广西HIV-1主要亚型.pdfVIP

· 482· 主 塞墅塑堕 童兰盘查 生 !旦箜垫堂箜 塑— 1hi ! 墨xpClinViml，December2009，Vo1．23，No．6 ． 技 术 方 法 ． 应用多重巢式PCR法快速鉴定 广西 HIV．1主要亚型 苏齐鉴 ，周平 ，闭志友 ，肖信 ，吴书志，岑平，邓伟，邵一呜 ，梁浩 【摘要】 目的 建立快速鉴定广西 HIV．1主要流行亚型 CRF01一AE、CRF07一BC、CRF08一BC、B和 c的多重巢式 PCR方法 。方法 针对 HIV—lgag基因设计 CRFO1一AE、CRF07一BC、CRF08一BC、B和 c 亚型特异性引物 ，建立多重巢式 PCR法 ，用该法鉴定来 自广西的HW．1毒株 的亚型，并与基因测序法 的鉴定结果 比较。结果 多重巢式 PCR法能正确鉴别5种已知亚型的样本，l0份 HIV阴性样本均无 扩增 ，在72份未知亚型样本 中，正确鉴定出 66份 ，分别属于 CRFO1一AE、CRF07 BC、CRF08一BC、B亚 型 ，多重巢式 PCR法 的灵敏度为 91．7％，特异度达 100％。结论 多重巢式 PCR法 能准确鉴定广西 CRF01一 AE、CRF07一 BC、CRF08一 BC和B亚型毒株，是一种简便、快速、低成本的亚型鉴定方法。 【主题词】 聚合酶链反应； HIV一1； 基因型 AnestedmultiplexPCRassayforrapidsubtypingtheprevailingHIV-1strainsinGuangxi SUQi-jian ． zHoU P g．BIZhi-you。XIA0Xin．WU sh zhi．CEN Pi喀 ．DENG Wei sHAo Yi-uring，LIANG Hao． CenterforAIDSResearch＆SchoolofPublicHealth，GuangxiMedcialUniversity，Nanning530021，China Correspondingauthor：LiangHao．Email：haolphd@ 163．con：Tel：077l一5358145 【Abstract】 Objective ToestablisharapidnestedmultiplexPeRassayforsubtypingHIV一-CRFO1一AE， CRF07一 BC．CRF08一 BC，B，andC strainsprevailinginGuangxi．Method Subtype—specificprimerswere designedforthese subtypesbasedon theirgag sequences．rrhe subtype sofHIV—lsamplesfrom Guangxiwere determinedbynestedmultiplexPCR andDNA sequencingandphylogeneticanalysis，respectively，andthen the sensitivityandthespecificityofnestedmultiplexPCR werecalculated．Results NestedmuhiplexPCR could correctlyclassifythe5known—subtypesamples，andwerenotreactivetoallHIV—negativesamples．Ofthe72HIV · positivesamples，66werecorrectly identifiedasCRFO1一AE，CRF07一BC，CRF08一 BC，and B by thisassay， givingasensitivityof91．7％ (66／72)，andaspecificityof100％．Conclusion 11Iisassayisasimple，fast，and AE，CRF07 BC，CRF08 BC，and B strainsprevailing in cost-effectivesubtypingmethodofrHIV--CRF01一 一 一 Guangxi． 【Keywords】 Polymerasechain