EWS-FLI1融合蛋白在尤文肉瘤细胞的表达分布及其融合区抗原表位的预测.pdf

摘要 摘 要 目的 融合区的T细胞表位、B细胞表位，为下一步实验提供实验依据。 方法 将尤文肉瘤细胞株A673进行传代培养，制作细胞爬片，用FLll特异性单 克隆抗体进行免疫细胞化学染色，分析融合蛋白EWS．FLll在细胞的表达分布， 并对其表达分布情况进行统计。 Epitope Databaseand Analysis T-cell CTL) 可能的HLA．A*0201限制性细胞毒性T细胞(cytotoxicepitopes， 表位。 性、表面可及性、抗原指数，综合各项分析，预测EWS．FLll融合区可能的B 细胞表位。 结果 免疫细胞化学染色实验显示，EWS—FLll融合蛋白阳性染色位于细胞核的 EWS细胞在所有EWS细胞的平均构成比为84．78％，位于细胞浆者为11．71％， 位于细胞膜者为3．51％。 结合4种T细胞表位预测软件，预测出最有可能的EWS—FLll融合区 HLA．A*0201限制性CTL表位共计9个。 根据EWS．FLll融合区的二级结构、氨基酸的亲水性、表面可及性、抗原指 数，预测出了最有可能的B细胞表位。 结论 EWS．FLll融合蛋白表达分布主要位于EWS细胞的细胞核，而在细胞浆和 细胞膜中只有少量表达。 应用T细胞表位预测软件及B细胞表位预测软件可成功预测出EWS．FLll 蛋白融合区的T、B细胞表位，为研究蛋白特征及研制复合表位疫苗奠定了基础。 摘要 关键词：EWS细胞；EWS．FLll融合蛋白；T细胞表位；B细胞表位； 免疫细胞化学； III Abstract ABSTRACT Objective fusion in the locationofEWS—FLll protein Investigateexpressing theTcell andB-cell of sarcoma epitopes Ewing’S cells，predict epitopes fusion ofEWS—FLI indictionforthenext region 1，whichprovideexperimental research． Methods with monoclonal Perform antibody immunocytochemicalexperimentspecific sarcomacelllines the FLI1 after A673，analyzeexpressing subculturingEwing’S EWS—FLIl in EWScells． 10cationof as bioinformaticsoftwares，such