蛋白质芯片发展与应用.pdfVIP

MedTheor＆Prac 2010 医学理论与实践2010年第23卷第7期J Vot．23，No．7，Jul 789 ·综述与讲座· 蛋白质芯片的发展及应用 刘辉琦刘 杰综述王生兰审校 青海大学医学院病理生理学教研室，青海省西宁市810001 关键词蛋白质芯片发展应用 中图分类号：R31，Q78文献标识码：A文章编号：1001—7585(2010)07-0789-04 人类基因组计划已经完成，但目前许多研究表 特异性的探针分子(如单克隆抗体、小片段抗体、受 明，仅从基因组学的研究并不能得到生物功能的完 体等)固定在载体上，用以识别复杂生物样品中的 整信息。蛋白质的翻译后修饰是影响蛋白质功能、 目标多肽、蛋白、抗原等。根据检测方法不同蛋白质 亲和性及细胞丰度的关键因素。因此，相对于基因 检测芯片又可进一步分为正相蛋白质检测芯片和反 相蛋白质检测芯片[8]。 组学，1994年Wilkin和Williams首次提出了蛋白 2．2根据芯片表面化学成分的不同蛋白质芯片 质组(proteome)的概念[1]。它的研究对象不再只是 针对～种或几种蛋白质，而是着眼于全面性和整体 分为[9]：(1)化学表面芯片：又可分为疏水、亲水、弱 性来研究体系内所有蛋白质的性质与功能。这就需 阳离子交换、强阴离子交换、特异结合等，用于检测 要在DNA芯片的基础上建立一种高通量、快速、直 未知蛋白，并获取指纹图谱。(2)生物表面芯片：分 接、高质量的微阵列方法来研究蛋白质。蛋白质芯 为抗体一抗原、受体一配体和DNA-蛋白质芯片等。 片(protein mi— 2．3根据载体的不同 蛋白质芯片分为[10J：普通 chips)或称蛋白质微阵列(protein 玻璃载体芯片、多孔凝胶覆盖芯片及微孔芯片。近 croarrays)技术就是顺应这一需要而发展起来的。 1蛋白质芯片的原理 年还发展起来许多借助DNA芯片技术的蛋白质芯 蛋白质芯片是将各种蛋白质有序地固定于滴定 片技术，如通过特异性DNA结构域在DNA芯片 板、滤膜、载玻片等各种载体上成为检测用的芯片，然 表面制成的蛋白质芯片[111，通过mRNA-蛋白质共 后用标记了特定荧光抗体的蛋白质或其他成分与芯 价交连融合技术制成的蛋白质芯片[121，自组装蛋白 片作用，经漂洗将未能与芯片上蛋白质互补结合的成 质芯片[13]。 分洗去，再利用荧光扫描仪或激光共聚焦扫描等技 术，测定芯片上各点的荧光强度，通过荧光强度分析 蛋白质与蛋白质(图1)[2]之间相互作用的关系，从而 达到测定各种蛋白质功能的目的。从德国科学家 Lueking等[3]最早开始研究至MacBeath等[4]成功制 备了10800点的蛋白质微阵列，蛋白质芯片已走出基 因微阵列的阴影，获得巨大的发展。归纳起来，蛋白 质芯片主要有以下优点[5’6]：(1)蛋白质芯片上可以实 现成千上万个蛋白质样品的高通量平行分析。(2)高 的信噪比。(3)所需样品量极少，检测水平已达ng 级。(4)在基因组和蛋白质组水平将DNA序列信息 与蛋白质产物直接联系起来。 2蛋白质芯片的分类 2．1根据用途的不同蛋白质芯片可大概分为[7]： 圈1蛋白质芯片所捕获的分子 (1)蛋白质功能芯片：将天然蛋白、酶或酶底物点加 注：(a)抗原—抗体的反应；(b)抗原—抗体的夹心反应；(c)特异性 在载体上制成芯片，可用来进行蛋白一蛋白、蛋白一