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2009 年第 29 卷 有 机 化 学 Vol. 29, 2009
第 11 期, 1700～1707 Chinese Journal of Organic Chemistry No. 11, 1700～1707
·综述与进展·
金属卟啉对杂环及 DNA 分子识别的研究进展
朱隆懿 a,b 孙 羽 b 王 倩 a 吴 师*,a
(a 浙江大学化学系 杭州 310027)
(b 浙江大学生物工程系 杭州 310027)
摘要 介绍了近几年国内外关于组装金属卟啉对杂环分子、DNA 碱基以及 RNA 的分子识别的研究进展, 并简述了本
课题组对金属卟啉与杂环及药物分子复合物的理论研究工作. 金属卟啉广泛存在于自然界和生物体中, 此识别过程
研究和模拟生命体中各种细胞之间的相互作用具有重要意义. 组装后的金属卟啉可通过轴向配位、氢键及 π-π 堆积作
用等识别杂环分子. 金属卟啉 DNA 的识别主要有四种作用方式, 而金属卟啉 DNA 以及RNA 分子的识别主要靠疏
水作用力、静电力以及自堆叠作用. 卟啉阳离子与 DNA 的结合位点受主体侧链取代基的空间结构影响. 金属卟啉对药
物分子的识别靠配位键和氢键进行, 以配位键结合的复合物通常具有更高的结合能.
关键词 金属卟啉; 杂环; DNA; 药物分子; 分子识别
Progress in Binding Affinities of Metal Porphyrins to
Heterocycles and DNA
Zhu, Longyia,b Sun, Yub Wang, Qiana Wu, Shi*,a
(a Department of Chemistry, Zhejiang University, Hangzhou 310027)
(b Department of Bioengineering, Zhejiang University, Hangzhou 310027)
Abstract The novel development on the binding affinities of self-assembled metal porphyrins to heterocy-
cles, DNA base pairs and RNA has been introduced. Theoretical research in our group on the complexes
formed by the metal porphyrins with heterocyclic and pharmaceutical molecules has been summarized. The
metal porphyrins widely exist in the natural world and biological organisms. These binding processes are
important to exploring and simulating the interactions among dif
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