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癌症中基因环境的相互作用
Paolo Vineis
Torino 大学ISI基金会
意大利Torino
Email地址:paolo.vineis@unito.it
基因决定论的局限
1. 人类和老鼠有相同估计数目
的表达基因.
2. 人类和黑猩猩共享98% 的基
因组.
3. DNA 的序列信息是不够用来
决定基因是如何相互作用以
产生一个生物有机体的.
• 仅在少数情况下, 基因通路与有机体的功能
是完全特定的, 如单基因疾病(镰刀型贫血
症,muscle distrophy). 此时, 细胞没有其他的代偿
途径, 而环境的干扰为零“一个突变基因--一
种疾病模式”.
• Strohman:”细胞更像是一个完整的
适应性系统, 而非一个提供基因机械
工作的工厂.”
一些数据
• 女性一生中患乳腺癌的几率是12.6%, 男性一生
中患前列腺癌的几率是15.9%,两性患结肠癌的
几率是5.6%.
• BRCA1与BRCA2引起乳腺癌的相对危险度(RR)是
5-10.
• LOC1错配修复基因型引起结肠癌的相对危险度
(RR)是9.3.
• 与代谢多型有关基因的突变引起一些癌症的相
对危险度(RR)小于2.
• 大约0.25%的女性携带易得病的BRCA1或
BRCA2 突变型,0.1% 的人携带易得病的错
配修复LOC1 突变型.
•这些基因型只能解释少于5% 的乳腺癌或
结肠癌.
• 20%的人携带阿朴脂蛋白E4 的
等位基因, 患Alzheimer 氏病的RR
大约为2; 而这个基因解释了16.7%
的Alzheimer 氏病.
多少癌症可以归咎于基因诱因呢?
• Lichenstein et al,N Engl J Med 343:78-85,2000
• 斯堪的纳维亚国家研究了44,788对双胞胎.
• 数值:
• 前列腺42%(95% CI 29-55)
• 结肠直肠35%(10-48)
• 乳腺27%(4-54)
• R .Hoover的评论:Gene-environment Interactions Are
Not Accounted For
(这些有可能是过高的估计)
注意不同的危险度测量方式
• 绝对危险度, 如, 一生中累加的危险(BRCA1
变异携带者有50-70% 的几率得乳腺癌).
• 相对危险度(外显率)=5-10 倍
• ARe=携带者患病比率=BRCA1携带者中有
80% 患乳腺癌.
• ARp=人群患病比率=5-10%的乳腺癌归因
于BRCA1 突变.
这是一篇演示文档,原版文档为PPT格式,下
载后可以编辑修改,浏览下载地址:
/see161-doc-11-1.html
当我们估计“ 筛选”的有效性时,
必须考虑:
• (A)可预言性, 依赖于该突变的普遍性
• (B)基因外显率(NNT)
• (C)最重要的是治疗或预防措施
的可获得性.
• 举例:
• 变异
• 有 无
• 检测
• 阳性 15 10
• 阴性 5 115
• 普遍性=20/145=13.8%
• 敏感性=15/20=0.75
• 特异性=115/125=0.92
• 阳性可预测值=15/25=0.60
• 即100个阳性结果中有60个携带
该突变基因
• 举例:
• 变异
•
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