癌症中基因环境的相互作用.pdf

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癌症中基因环境的相互作用 Paolo Vineis Torino 大学ISI基金会 意大利Torino Email地址:paolo.vineis@unito.it 基因决定论的局限 1. 人类和老鼠有相同估计数目 的表达基因. 2. 人类和黑猩猩共享98% 的基 因组. 3. DNA 的序列信息是不够用来 决定基因是如何相互作用以 产生一个生物有机体的. • 仅在少数情况下, 基因通路与有机体的功能 是完全特定的, 如单基因疾病(镰刀型贫血 症,muscle distrophy). 此时, 细胞没有其他的代偿 途径, 而环境的干扰为零“一个突变基因--一 种疾病模式”. • Strohman:”细胞更像是一个完整的 适应性系统, 而非一个提供基因机械 工作的工厂.” 一些数据 • 女性一生中患乳腺癌的几率是12.6%, 男性一生 中患前列腺癌的几率是15.9%,两性患结肠癌的 几率是5.6%. • BRCA1与BRCA2引起乳腺癌的相对危险度(RR)是 5-10. • LOC1错配修复基因型引起结肠癌的相对危险度 (RR)是9.3. • 与代谢多型有关基因的突变引起一些癌症的相 对危险度(RR)小于2. • 大约0.25%的女性携带易得病的BRCA1或 BRCA2 突变型,0.1% 的人携带易得病的错 配修复LOC1 突变型. •这些基因型只能解释少于5% 的乳腺癌或 结肠癌. • 20%的人携带阿朴脂蛋白E4 的 等位基因, 患Alzheimer 氏病的RR 大约为2; 而这个基因解释了16.7% 的Alzheimer 氏病. 多少癌症可以归咎于基因诱因呢? • Lichenstein et al,N Engl J Med 343:78-85,2000 • 斯堪的纳维亚国家研究了44,788对双胞胎. • 数值: • 前列腺42%(95% CI 29-55) • 结肠直肠35%(10-48) • 乳腺27%(4-54) • R .Hoover的评论:Gene-environment Interactions Are Not Accounted For (这些有可能是过高的估计) 注意不同的危险度测量方式 • 绝对危险度, 如, 一生中累加的危险(BRCA1 变异携带者有50-70% 的几率得乳腺癌). • 相对危险度(外显率)=5-10 倍 • ARe=携带者患病比率=BRCA1携带者中有 80% 患乳腺癌. • ARp=人群患病比率=5-10%的乳腺癌归因 于BRCA1 突变. 这是一篇演示文档,原版文档为PPT格式,下 载后可以编辑修改,浏览下载地址: /see161-doc-11-1.html 当我们估计“ 筛选”的有效性时, 必须考虑: • (A)可预言性, 依赖于该突变的普遍性 • (B)基因外显率(NNT) • (C)最重要的是治疗或预防措施 的可获得性. • 举例: • 变异 • 有 无 • 检测 • 阳性 15 10 • 阴性 5 115 • 普遍性=20/145=13.8% • 敏感性=15/20=0.75 • 特异性=115/125=0.92 • 阳性可预测值=15/25=0.60 • 即100个阳性结果中有60个携带 该突变基因 • 举例: • 变异 •

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