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人类基因组计划
(Human Genome Project,HGP)
1.什么是人类基因组计划:
人类基因组计划是由美国能源部和NIH联合做出的,自1990年开始,争取在15年内完成的目标。
即: 鉴定人体DNA估计约8万个基因,测序构成人DNA的30亿个碱基,贮存这些信息于databases(数据库)并发展data analysis的工具。
实际包括两部分工作,一是 mapping,一是sequencing,故先前叫做“Mapping and Sequencing the human genome”.而Mapping又分为遗传连锁图谱和物理图谱。
HGP是第一个庞大的科学事业,会引起一些由此计划暴发出来的伦理、法律、社会学上的诸多争论。(DOE熟悉大科学模式;生物学家习惯小科学模式,应完美结合。该计划会引发出许多商业和法律,社会学和论理学方面的问题。)
为了有助于这些目标的实现,还要研究一些非人生物体的遗传图谱。(包括E.coli、酵母、秀丽隐杆线虫、果蝇、实验用小鼠等模式生物。)
在植物方面,美国农业部集中研究玉米和南芥菜(Arabidopsis)基因组,我国科学家提出了水稻基因组计划。
2.背景:
早在1984年Utah州Alta城的专业会议(DOE环境与健康研究办公室,OHER和国际环境诱变剂和致癌物防护委员会,ICPEMC协办)。开始讨论HG DNA全序列测定的前景。
1985年5月由Sinsheimer组织专门会议提出测定HG全序的动议。
DOE为何操办:(1)DOE承担低水平辐射和其它环境因素引起的遗传性损伤的监测,即需要在108bp的DNA中检测出一个碱基的改变,此项任务与HG全序列测定有关并且任务同等艰巨;(2)DOE已在两个国家实验室对复杂基因开展了工作,即1988年的国家基因文库计划(NG Library Project),在Laurence Livermore国家实验室(LLNL)中纯化单种染色体并构建单个染色体文库。另一个基础性工作是1983年在Los Alamos National Laboratory(LANL)建立DNA顺序信息库Gene Bank。DOE特别在信息科学上具有经验和优势,还是大科学模式计划上的内行。
NIH 的参与又是必不可少的。(习惯于资助对特定科学进行检验的小型项目。还未主持过大科学模式的Project)。
终于1988年10月DOE与NIH在HGP的实施管理上达成协议(Science 241,1596 1988)。这样,同年二月由国家科学委员会(NRC)的专家组拟定的“人类基因组的图谱和测序”的专题报告才得以走向实现。
在1984-1989年间,在HGP从动议到实施这一漫长岁月里,许多有关技术上的进步和成就也是促成此事的重要因素。
1990年10月正式启动。
3.何谓基因组:
Genome is all the DNA in an organism, including its genes.
Gene: 携带制造为生物体所需要蛋白质的信息。
Because all the organisms are related through similarities in DNA sequences , insight gained from nonhuman genome often lead to new knowledge about human biology.
4.弄懂DNA有什麽实际的 benefits?
关于不同个体间DNA变异后果的知识将引导我们得到解决诊断、治疗以及某一天能够预防上千种危害我们的疾病的革命性的新手段、新途径和新方法。
除提供了解人类生物学的思路之外,探知非人生物体的DNA sequences能够导致了解它们的天然潜在能力(natural capabilities ),看其中能够用来解决人类保健,能源和环境净化上的挑战性课题。(Francis S Collins, head of HGP ,or National center for HG Research)
5.中国:
重点是研究我们特有的致病基因的图谱和定序。现阶段是Hunting of Hereditary Disease Gene以及与白血病细胞分化有关的基因研究。后来有又加上重要功能基因。向外表述为:“Identification of disease genes and genes with important biological function is one of the major targets of the HGP in China.”
上述工作分别在南北两中心分担,即国家人类基因组南方
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