高温芽胞菌资源多样性、系统发育及环境适应分子机制研究.docVIP

高温芽胞菌资源多样性、系统发育及环境适应分子机制研究 一、立论依据 生物多样性是地球上所有的生物——植物、动物和微生物及其生存环境的总和，包括遗传多样性、物种多样性、生态系统多样性 高温芽胞杆菌（Thermophilc bacil）是一些耐高温芽胞杆菌的统称，包括芽胞杆菌科内多个属种。高温芽胞杆菌的最适生长温度多在55℃到65℃之间，可以耐受70℃以上的高温。高温芽胞杆菌分布广泛，在温泉、火山口和堆肥等高温环境，土壤常温环境和极地低温环境中均有分离到高温芽胞杆菌的报道。高温芽胞杆菌广泛应用于生产生活，如抗生素检测、灭菌指示剂和各种食品和工业酶类。但是，高温芽胞杆菌基于环境适应的分布多样性特征有待于进一步研究；高温芽胞杆菌的分类地位和系统发育研究仍不够完善；有关高温芽胞杆菌环境适应尤其是温度适应的机制仍未彻底解决。开展高温芽胞杆菌菌种资源的多样性、系统发育和环境适应分子机制的研究对于我国高温微生物菌种资源的普查、收集、整理以及高温微生物的地理分布特征和系统分类意义重大，为高温微生物资源的开发利用打下基础，对于理解生命的温度适应及进化机制有着重要的理论价值。 二、国内外研究现状和发展趋势 早期芽胞杆菌的分类仅仅以“杆状可形成对逆境有抗性的内生芽胞[1]”这两个特征为基础进行形态学分类，高温芽胞杆菌和常温菌混于早期的分类系统中。1949年Gordon 和Smith分析了收集到的206株喜温菌，并以是否可在65度生长将其中160株归为B. stearothermophilus 和 B. coagulans。[2]，此时Gordon 和Smith已经预示高温芽胞菌是一个丰富多样的群体。自此以后三十多年对高温芽胞杆菌多样性的研究进展缓慢。1993年，White等[3]分析了采自全球范围的234株高温芽胞杆菌96个表型特征，发现这些菌之间有明显的差异。White把这些菌依据表型特征归为18个类群，其中一些与已知芽胞杆菌一致，另外一些得到新的命名。分子生物学技术的应用为微生物分类鉴定带来了革命性的发展，Ash等[4]比较芽胞杆菌属51个种的16SrRNA序列，发现它们落入5个不同的group里。这一工作标志着芽胞杆菌属重新分类的开始。随着多项分类技术应用于Genus Bacillus,对Bacillus的科学分类进行了深入研究。之后一些芽胞杆菌脱离芽胞杆菌属成为独立的属，其中Genus Geobacillus[5]、 Genus Ureibacillus[6]和Genus Alicyclobacillus[7]等属均为高温芽胞菌，它们最适生长温度在60℃左右，可以在70℃以上高温生存。目前正有越来越多的高温芽胞菌新种得到鉴定，以Genus Geobacillus为例，地芽胞杆菌属（Genus Geobacillus）是隶属芽胞杆菌纲的一个新属，该属于2001年建立，该属刚建立时包括Geobacillus thermoleovora、Geobacillus kaustophilus、Geobacillus thermocatenulatus、Geobacillus stearothermophilus、Geobacillus thermodenitmficans、Geobacillus caldolyticus、Geobacillus caldotenax、Geobacillus caldoveloxGeobacillus caldoxylosilyticus[8]、Geobacillus debilis[]、Geobacillus pallidus[]、Geobacillus lituanicus[]、Geobacillus tepidamans[]、Geobacillus jurassicus[]、Geobacillus zalihae[]和Geobacillus galactosidasius[]等新种归入该属。 辽阔的国土和复杂多样的地理环境造就了我国丰富的微生物资源。西藏，云南和福建等地有适合高温菌栖息的地热温泉环境，油田、火山口、堆肥、甚至常温土壤中均有分离到高温芽胞菌的报道。另外，检索国内菌种保藏机构也发现大量耐热芽胞菌相关菌种。但是，我国在该领域内的工作只是根据菌种16SrRNA同源性将其简单归入属一级，很少有结合模式菌株做系统的分类鉴定研究。查阅《International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology（IJSEM）》近年发表文章发现，国内微生物系统分类鉴定工作主要集中在中科院微生物所、浙江大学和云南大学等少数高校和科研院所，国内对高温芽胞菌资源分类鉴定和系统发育研究相对较少。《International Journal of Systemati