2007-2009 年华南地区鸭肝炎病毒流行病学调查及分离株的VP1 基因变异分析[J].pdfVIP

中国动物传染病学报 2010，18(1)：7—15 ChineseJourna1ofAnimalInfectiousDiseases · 研究论文 · 2007~2009年华南地区鸭肝炎病毒流行病学调查 及分离株的VP1基因变异分析 何冉娅 ，于 淼，张玉玲，张得玉，曹宗喜，张桂红 (华南农业大学兽医学院，广州 510642) 摘 要 ：为 了分析华南地 区鸭肝炎病毒 (Duckhepatitisvirus，DHV)的遗传进化情况，本试验对2007-2009 年华南地区各鸭场发病雏鸭进行DHV的病原学检测以及VP1基因扩增、克隆和测序 ，并运用生物信息学软 件对VP1基 因进行 了序列分析。结果表明：所分离的R、SS1、zJg+为DHV-A、VP1与DHV-A参考毒株核苷 酸序列相似性分别为93．8％-100％、93．7％～99．6％、91．7％-98．9％，氨基酸序列相似性分别为94．5％-100．0％、 94．1％-99．2 、95．0％一99．2 。其余15株DHV-C分离病毒株与台湾新型DHV核苷酸和氨基酸序列相似性均 在71．4％～72．0％和78．2％-79．0％之间，与韩国新型DHV相似性在94．0％-95．1％和91．6％-93．3％之间，与国 内分离的新型DHV相似性均在97．9％～100．0％和97．5 ～100．0％之间。VPl氨基酸序列比对分析表明：VPl 的高变区主要分布在46～64、95～149、180～223位，尤其是C末端，存在点突变或连续变异。在第145-146 位 ，15株新型DHV毒株l,e．3株I型DHV多2个氨基酸 (G和G)。小RNA病毒科的VP1蛋 白中保守的RGD基序 ， 在DHV中分别显示为SGD和QSD。结果表明，危害华南地 区鸭场的DHV已经发生变异 ，且存在两种基因 型毒株 的流行 。 关键词：鸭肝炎病毒；变异；VP1；序列分析 中图分类号：Q858．322．659．6：Q78 文献标识码：A 文章编号：1674—6422 (2010)o】一0007—09 收稿 日剐：2010-01—11 基金项 目：国家 自然科学基金 作者简介：何冉娅，女，硕士研究生，主要从事禽病分子病毒学研究 通讯作者：张桂红，E—mail：guihongzh@scau．edu．cn associateddiseaseinswineinOntario(2004to2005)[J3．Can 的基因型分析 [J]．畜牧兽医学报，2009，40(9)：1358—1362． VetJ，2006，47：761—762． [12]TianKG，YuX，ZhaoT，eta1．EmergenceoffatalPRRSV [7]GagnonCA，TremblayD，TijssenP’eta1．Theemergenceof variants：unparalleledoutbreaksofatypicalPRRSinChinanad porcinecircovims2bgenotype(PCV-2b)niswnieniCanada[J]． moleculardissectionoftheuniquehallmark[J] ． PloSONE， CanVetJ，2007，48：8l1—819． 2007 ． 6：e526． [8]CheungAK，LagerKM，Kohutyuk01，eta1．DetectionoftⅥ，。 [13]OpriessrtigT