大豆分子标记遗传图谱整合及其的应用.pdfVIP

大豆分子标记遗传图谱整合及其的应用.pdf

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第28卷 第4期 大 豆 科 学 V01.28 Nn4 2009矩 8月 S0YBEAN SCIENCE Aug. 2009 大豆分子标记遗传图谱的整合及其应用 周 斌 ,邢 邯 ,陈受宜 ,盖钧镒 (南京农业大学大豆研究所 国家大豆改良中心作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095;中国科学院遗传与发育生物学研究 所植物基因组学国家重点实验室,北京 100101) 摘 要:图谱整合是弥补单个作图群体因分子标记多态性的局限性而难以构建高密度图谱的有效方法。利用具明 显农艺性状差异的大豆品种间杂交组合 (科丰 1号 ×南农 1138.2、南农87.23×NG94.156、苏88.M21×新沂小黑豆 和皖82—178×通山薄皮黄豆甲)所衍生的重组 自交系群体分别构建了含有560,223,195,133个分子标记的遗传连 锁图谱。以各图谱共有SSR标记作为锚定标记,使用 JoinMap3.0进行图谱整合,得到一张包含2O个连锁群,795 个分子标记 ,总遗传距离2772.9cM,平均间距3.49cM的整合图谱。各连锁群的标记个数在24—69之间,遗传距 离在77.1—224.7cM之间。与Song等的公共图谱比较,标记在连锁群上的分布和位置高度吻合,并增加了5个公 共图谱上没有的SSR标记 ,另有6个SSR标记定位在不同的连锁群上。通过整合图谱可将关联分析所获基因/ QTL定位到连锁群区间;便于不同群体定位结果间的比较;并找寻与之连锁更紧密的邻近标记。鉴于本图谱所用 作图群体的亲本与国内育种常用材料的遗传来源相近,将更便于国内育种性状的QTL定位研究。 关键词:大豆遗传连锁图谱 ;整合图谱;SSR 中图分类号:$565.1 文献标识码 :A 文章编号:1000—9841(2009)04.0557.09 An IntegratedGeneticLinkageM apofSoybeanandItsApplication ZHOU Bin ,XINGHan ,CHEN Shou.yi,GAIJun.yi (SoybeanResearchInstituteofNanjingAgriculturalUniversity,NationalCenterforSoybeanImprovement,StateKeyLaboratoryofCropGeneticsand GermplasmEnhancement,Nanjing210095,Jiangsu;TheStateKeyLaboratoryofPlantGemomics,InstituteofGeneticsandDevelopmentalBiology,Chi. nestAcademyofSciences,Being100101,China) Abstract:Integrationofgeneticlinkagemapsintoajointoneisaneffectiveapproachtoovercomethelimitationofnumber ofmarkersduetotheconstraintofpolymorphism inindividualspecificmappingpopulations.Inthepresentstudy,fourRIL populations,Kefeng1×Nannong 1138—2,Nannong87—23xNG94—156,Su88一M21×XinyixiaoheidouandWan82—178× TongshanbopihuangdoujiaderivedfromthecrossesbetweendistinctelitecuhivarsofGlycinemax(L.)Merr.wereusedat firsttoconstrnctindividualgeneticlinkagemapswith560,223,195 and 133markers,respectively,byusingthesoftwrae JoinMap3.0.Thenbasedonth

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