COBRA模型上代谢调控约束定量化研究.pdf

目 录 ffi w  I A b s t r a c t I I 第 一 章 绪 论  i 1.1 C O B R A 代谢 网络 建 模框 架 和生 化 网络 整合 研 宄  1  1.1.1. 基 于 理 论 的建 校  丨 1.1.2 . 基 于 约 束 的建 模  1 1.1.3. C O B R A 建 模 框 架  3 1.1.4 . 流 量 均 衡 分 析 （F B A )  4 1.1.5. 代 谢 网络 分 析 方 法 的发 展  6 1.1.6 . 代 谢 网络 C O B R A 建 模 的发 展  7 1.2 集 成 调控 网络 的代 谢 网络 研 究  7 1.3 本 文 的主 要 工 作  10 第 二 章 COBRA 模 型 代 谢 调 控 约 束 的 定量 化 研 究方 法  12 2.1 方 法 流 程 及 简述  12 2.2 基 因芯 片数据 二 元 化 (B inarization )  13 2 .3 基 因之 间 的调 控 分析 及 调 控 定 量 化 计 算  15 2 .3 .1 规 则转 换  15 2 .3.2 P 值 计 算  17 2.4 无 调控 约束代 谢 网络 流 量可 变 分析  19 2 .5 整 合 定量 调 控 约 束 的代 谢 网络 模 型