第十章微生物的分类鉴定.pptVIP

第13章 微生物的分类与鉴定 分类系统不管是生物的,还是非生物的,都是信息存取系统, 这个系统的建立是为了存入或者取出信息,便于查找,考证,便于使用, 便于认识。 1.分类有以下三个目的:类有以下三个目的: (1)为了研究工作,生产应用,便于查找。 (2)了解生物进化途径。 (3)了解各生物间的亲缘关系。 2.任务： 分类、鉴定、命名 3.定义： 现代分类学基本上有两派,一派强调形态特征,一派强调亲缘关系。 形态特征————表现型 亲缘关系————基因型 按微生物的亲缘把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。 微生物分类的基本单位是“种”例如枯草芽孢杆菌的分类顺序如下: 界-原核生物界(procaryatae) 门--原壁菌门(Firmicutes) 纲---芽孢菌纲(Bacilla) 目----芽孢菌目(Bacillales) 科-----芽孢菌科(Bacillaceae) 属------芽孢杆菌属(Bacillus) 种--------枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) 种的概念： 种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式种。 种与其它分类级的区别在于: 1.它是繁殖的基本单位。 2.它是分类的基本单位。 3.划分种要有标准菌株: 标准菌株是人们最先发现,并进行过描述具有典型特征的菌株。 新种： sp.nov.或nov. sp.，新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许人们从中取得。 一个微生物新种的建立必须在IJSB(International Journal of systematic Bactiology)(国际系统细菌学杂志)上发表。然后被添加在《细菌名称批准目录》中。 新种的标准菌株要送交“世界菌种保藏联合会”(WFCC),并存入微生物资源中心( Microbiologycal Resources Center)简称(MIRCEN)。 细菌名称发表的优先权为1980年1月1日,即《细菌名称批准目录》中没有的1980 年1月1日以后谁先发表属于谁。 亚种是种以下的唯一分类单位。也是分类地位的最低等级, 微生物学中把实验室获得的稳定变异型菌种称为亚种。 变种是亚种的同义词,因会引起混乱,故不主张使用,在新的命名法中没有地位。 亚种以下的术语有: 生物变异型(biovar) 化学变异型(chemovar):产生某种化合物或其产量异常。 致病变异型(pathovar):对一个或多个寄主的致病反应。 噬菌体变异型(phayovar):对噬菌体的反应。 血清变异型(serovar):抗原特性。 其它术语: 克隆:是从单个亲本细胞得来的细胞群体。 菌株:是由纯培养的单个分离物的后代组成的,菌株通常是由单菌落衍生而来, 而产生原始菌落的菌数是未知的,故大多数菌株不被认为是克隆。 菌株编号:从自然界分离到的微生物尽管属于同一个种,但由于它们来源不一样,它们之间总会有些细微差异,这些同种但来源不同的纯培养体就是不同的菌株。 通常用编号表示如7216、140等。 群:在自然界中有些微生物的种类其特征介于两个种之间,彼此不易严格区分,于是我们就把这两个种和介于它们中间的一些微生物统称为一个“群”。 三、命名法规及双名法： 关于原核微生物的命名, 国际上有一个“国际细菌命名法规”该法规有以下主要规定: 1.细菌名称发表的优先权为1980年1月1日。 在1980年1月1日以前,由斯克尔曼教授为主对世界上的细菌名称进行了清理,保留了3500个菌名,废除了26400个菌名,从1980年1月1日起,凡是保留的3500个菌名以外的谁先发表属于谁。 2.新种的命名不应与已发表的真菌,藻类、原生动物同名。 3.种名要用拉丁文,用双名法表示,新种要有典型菌株,新属要有典型种,并要同时发表菌种的保藏号。 4.新种(属)要在“国际系统分类细菌学杂志”(IJSB)上发表。 5.菌名的更改要得到仲裁委员会同意,并发表在IJSB上才能有效。 微生物的学名：菌种的科学名称。 命名原则：由“属名+种名”构成； 属名：用希腊字或拉丁字或拉丁化了的其它文字组成。属名用来描述主要特征，如形状、构造或者科学家的名字； 种名：用拉丁文或拉丁化的文字或人名表示,种名用来描述色素,来