分子系统发育分析的生物信息学方法.pdfVIP

第 卷 第 期 计 算 机 科 学 ３７ ８ Ｖｏｌ．３７Ｎｏ．８ 　 年 月 ２０１０ ８ Ｃｏｍ ｕｔｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ａｕ ２０１０ ｐ 　 ｇ 　 分子系统发育分析的生物信息学方法 ， ， ， 张树波１ ２ ４ 赖剑煌３ ４ 　 １ ２ （ ） （ ） 广州航海高等专科学校计算机系 广州５１０７２５ 中山大学数学与计算科学学院 广州５１０２７５ 　 　 　 ３ ４ （ ） （ ） 中山大学信息技术与科学学院 广州５１０２７５ 广东省信息安全技术重点实验室 广州５１０７２５ 　 　 　 　 ， ， 摘 要 物种之间的系统发育分析研究物种的形成或进化历史 以及物种之间的进化关系 它是当代生命科学研究的 　 　 。 ， 一个重要分支 分子生物学和计算机科学的发展 为人类采用计算的方法从分子水平研究生物的进化历史以及探索 。 ， ， 生命的起源提供了新的思路 在过去的几十年中 基于分子水平的系统发育学研究取得很大的进展 各种各样基于分 。 ， 子水平的系统发育树推断方法被提出来 现从物种进化距离刻画和系统发育树重构算法两个方面 总结和评述了在 ， ， 过去十几年里 人类利用生物信息学方法在分子水平上研究物种进化关系的进展和取得的成果 分析了物种进化研究 ， 。 存在的问题和面临的挑战 指出了物种进化研究今后的主要方向 ， ， ， ， ， 关键词 生物信息学 系统发育分析 基因进化 最大简约法 最大似然法 邻接法 　 中图法分类号 ＴＰ