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研究生科研实验教学基地建设基本实验技能培训 1.1 基因组DNA提取原理 1.2 基因组DNA提取 仪器准备: 台式离心机、恒温水浴锅、紫外分光光度计、移液器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)、镊子(灭菌)、离心管架 试剂准备: 试剂盒、无水乙醇等 试剂盒 计算公式: OD260/OD280=1.7-1.9 DNA浓度(ug/ul)=OD260×50×稀释倍数/1000 OD260=0.1 稀释倍数=250 DNA浓度=0.1×50 ×250/1000=1.25 ug/ul 操作注意事项 2.1 PCR体系和循环条件(重点) 配置1%的胶:称1g琼脂糖于适当大小三角瓶中,倒入100ml的1*TAE,微波炉加热至完全融化; 待凝胶温度降至50-60度时,加入1ul的EB(10mg/ml),摇匀,将胶倒入放好梳子的电泳板中,自然冷却30-60分钟; 轻轻拔掉梳子,将胶放入电泳槽中,倒入1*TAE,没过加样孔; 按照1ul上样Buffer+5ul的DNA混合后,点样;每排留一个孔加DNA marker; 100V电泳30分钟,凝胶成像仪照相。 作 业 实验记录 姓名,日期,试剂批号等 实验设计 DNA提取步骤 PCR体系和循环条件 配胶和电泳方法 * * 首都医科大学附属北京朝阳医院 基础医学研究中心 · 梁燕 liangyan1990@ 主要内容 1.DNA的提取 DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项 2.PCR PCR体系和循环条件 PCR操作步骤 操作注意事项 3.琼脂糖凝胶电泳 凝胶电泳原理 电泳方法步骤 操作注意事项 1.DNA的提取 DNA提取原理 DNA提取方法 操作注意事项 既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离, 又要保持DNA分子的完整。 试剂盒内容 操作步骤(重点) 向52ml的缓冲液GD中加入68ml无水乙醇,并标记;向50ml的缓冲液PW中加入200ml无水乙醇,并标记; 取200ul全血,加入20ul的蛋白酶K溶液,混匀; 加入200ul缓冲液GB,充分颠倒混匀,56℃放置10分钟,期间颠倒混匀数次,溶液应变清亮。 加入200ul无水乙醇,充分颠倒混匀,此时可能会出现絮状沉淀。 将吸附柱CB3放入收集管中准备好,将上述溶液移到吸附柱CB3中,12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;如果步骤5的溶液不能一次加完,可以再次重复步骤6; 向吸附柱中加500ul的缓冲液GD, 12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管; 操作步骤(重点) 7. 向吸附柱中加入700ul漂洗液PW, 12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管; 向吸附柱中加入500ul漂洗液PW, 12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管; 将吸附柱和收集管再次离心, 12000rpm离心2分钟,将吸附柱至于室温放置数分钟; 将吸附柱转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50-200ul洗脱缓冲液TB,室温放置2-5分钟, 12000rpm离心2分钟,将溶液收集到离心管中; 测OD值,计算DNA浓度和纯度;或电泳估计DNA浓度。 避免样品反复冻融 56℃水浴摇匀可消除GB中的沉淀 使用台式离心机,室温离心 2.PCR PCR体系和循环条件 PCR操作步骤 操作注意事项 仪器准备: PCR仪,微型离心机、移液器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)、镊子(灭菌)、离心管架 试剂准备: ddH2O, PCR Buffer,dNTP,引物,PCR聚合酶,DNA模板 *2 48ul 24ul Sum 1ul 1ul Template DNA(0.1ug/ul) 48/2=24ul 2ul 1ul Ex Taq (1U/ul) 2ul 1ul Primer R (10mM) 2ul 1ul Primer F (10mM) 4ul 2ul dNTP (25mM) 5ul 2.5ul 10×Buffer 33ul 16.5ul ddH2O 25ul Total volume BclI PCR 60 ℃, 30s 72 ℃, 30s 95℃, 30s 95℃,30s (预变性) 72 ℃,30s (后延伸) 30cycles 2.2 PCR操作步骤(重点) 计算好所需扩增的PCR体系; 打开PCR仪预热,设置PCR循环条件; 准备试剂,融化,离心,置于冰上,备用; 按顺序加样,混匀,离心,分装; 加入模板DNA,混匀,离心; 放入PCR仪,Start。 2.3 PCR操作注意事项 避免试剂反复冻融 计算总量,顺序加样
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