杜伯文犬vWF基因的PCR-SSCP分析.pdfVIP

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张匿擞’ 盼俊华2徐黎2杨蓠簧2舒邓群1圣孝乎帮 攘簧:臻-的分析毂稿文犬vWF蒸嚣串攀碡3蠢含子5侧翼送翡多悫髓,了憋vWD基因 颡率,为遗传育耪,培鬻出更船傀嶷缒警弼工作犬莫定基磁。方法苯越咒R—SSCP技术, 裙,vWF基隈第43巍螽予5铡翼区,枣剜其鸯多态牲,袭瑗为焱、G’鼹个等健基嚣纛姒、GG、 AG三种基爨型。结论经统嚣分析续累表髑在试验桂镳文犬巾群体多态信息含量(PIC)沟 低度多态;vWD基因频率势10%,与所报道的60%差异较大,这可熊是样本太小与人工选 育所致。 美键词:柱馅文犬;v瓣;PCR—SSCP 在犬类众多静遗传瘸中,斑管性假趣发病(vWD)是蹴较常觅的一种,共有的稀纯种犬 与血管性假鹿发病有关,其中戳杜伯文(DobermanPinscher)婚发病率最离。研究表啕,巍管 性假悫友瘸的发生取决予斑液孛血管性假盟发病因予(vWF)的数摄和质量。vWF是一种 太分子爨的多聚体糖蛋自,遗机体受翻矮伤时介导盘小板牯附到损伤内皮纲臆暴露的胶簌 寝面形成盘小摄血栓。一整vWF基因发生缺损,这种糖餐寓就将疑麓,逮使得蛊囊、板秃法 正常的粘连在~起。 vWF vWF餮裔淑22个氨基酸缀威翡信号驶、741个氨基酸豹缀默翻2050个氨基酸的戏熟鬣盘 滏,荚与vWF23—34外显予廖捌高度潮源。这个缓基因疑在人类秘离等灵长类枣才出现。 非常搁钕,通过毖对蘑可以发现,犬和人的eDNA序列具有86。8%能阚源性婚j。 灼疆究提供分子资料,对犬vW转的进~步研究具有攘要意义。本试验l获牲伯文犬为材料, 拟利用犬vWF基因豹糨关信息,迸一步研究桂馈文vWF基阂,并为杜德文犬育种提供参 考。 172 1.材料和方法 1.1试验材料 试验犬为杜伯文犬,共35头,来自某警犬基地。前肢静脉采血,5ml/头,枸橼酸钠抗凝, 一20℃冻存。 法保持一致。 1.2引物设计 136bp,引物由上海生工合成。引物序列如下: 7一CTGTGAGGACAACTGCCTGTC一3’ P1:5 P2:5’一TGGCCCTGAACCAGAAATrACTCAAG一3’ 1.3犬血基因组DNA的提取 J。 按常规酚氯仿法提取基因组DNA【4 1.4 PCR扩增 mmol/L mmol/LdNTPs 反应总体积为1011,其中10×buffer 1止,20 MgCl20.6出,2 0.21zl,lOv.mol/L引物0.3肛l,2U/出TaqDNA聚合酶O.08斗l,40 ng/斗!DNA模板O. min,94oC变性1min,63℃复性1rain, 8止,ddH207.1出。反应条件:94℃预变性3 72℃延伸1min,30个循环,72℃延伸10min,4℃保存。扩增产物用8%聚丙烯酰胺凝 胶电泳检测。 1.5PCR—SSCP多态性检测 0.025%二甲苯氰、lOmmol/L 变性10min,并迅速插入冰中,放置10min,使之保持变性状态。用12%聚丙烯酰胺凝胶 以130V的电压电泳12h一15h后银染分析。 1.6数据统计处理 2个等位基因,基因频 1.6.1基因频率和基因型频率的计算设某一基因位点有A和G 率分别为P和q,则:p=(2AA+AG)/2N; q=(2GG+AG)/2N 总个体数。 基因型频率=基因型个体数/测定群体总数 1.6.2多态信息含量(PIC)按Botstein等”1的公式计算 m m-I,雄 PIC=1-∑只2一∑∑2只2乎正—a l工—一占—■ I J i=1 i=Ij=i+l 其中P;和P{分别为第i和

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