红鲌属3种鱼类线粒体细胞色素b基因片段序列分析.pdfVIP

第 30卷第 1O期 2008年 10月 Vo1．30 NO．10 Oct． 2008 文章编号 ：1673—9868(2008)lO一0079—05 红鲔属 3种鱼类线粒体细胞色素 眦 b基因片段序列分析 S 西 冯晓宇， 谢 楠， 李行先， 许宝青 南_堇 大 浙江省 杭州市农业科学研究院，杭州 310024 学 U 学 摘要 ：测定了红鲐属 的翘嘴红鲐、青梢红鲐和蒙古红鲐细胞色素 b基 因片段序列 (1091bp)，对其碱基组成变异情 报 况及核苷酸序列差异进行 了分析 ，并以红鳍鲐为外类群 ，用邻接 (NJ)法和非加权算术平均对数(uPGMA)法构建 自 ( 系统关系树．结果表明：① 4种鱼(包括外类群)Cytb基因片段序列碱基平均差异为 6．2 ，变异住点184个，具有 然 N 简约性信息住点 141个，平均转换颠换比为 7．4；② 测定的红鲐属 3种鱼形成一个单系群 ，其 中翘嘴红鲐与青梢红 鲐亲科学缘m关 系较近． 关 键 词 ：红鲐属 (Erythroculter)；细胞色素 b(Cytb)；序列分析 中图分类号 ：$965．123 文献标识码 ：A 三苎 明 ∞ 红鲐属E (Erythroculter)隶属鲤形 目(Cypriniformes)、鲤科 (Cyprinidae)、鲐亚科 (Culterinae)，共有 9 d 个种和地理亚种u ，其 中，翘嘴红鲇 (E．ilishaeformis)、青梢红鲴 (E．dabryidabryi)和蒙古红铂 (E． mongolicu∞smongolicus)分布范 围最广 ，几乎遍布全 国各水系．对 红鲐属鱼类 的分类和系统发 育已有报 道 ，但主要是对形态的研究，基于线粒体 DNA基因序列的分析还较少．线粒体 DNA具有母系遗传的特 点，其包含的几个基因进化速度有所不同，可以根据不同需要选择不同的基因序列进行系统发育分析．细 胞色素 b(Cytb)基因因其进化速度适中被广泛地应用到鱼类属间、种间系统发育关系的研究，解决 了一些 分类和系统演化的问题。。]． 本文对翘嘴红鲴、青梢红鲇和蒙古红鲇 的线粒体 Cytb基 因片段序列进行测定 ，并 以红鳍鲴 (Culter erythropterus)为外类群进行分析 ，以期为整个红鲴属 以及鲐亚科 的鱼类分子系统发育研究提供依据． 1 材料与方法 1．1 材 料 以翘嘴红铂、青梢红鲔 、蒙古红鲐和红鳍鲇作为实验材料 ，数量各为 5尾．采集地点及时间如表 1所示． 表 1 实验材料采集地点和 时间 1．2 基因组DNA提取、PCR扩增及测序 取 0．1g无水乙醇保存鱼鳍样 品，用蒸馏水、STE(0．1mol／LNaC1、10mmol／LTris—C1、1mmol／I EDTA，pH 8．O)缓冲液浸泡洗涤直至将样 品中的乙醇去除，加入 900,／LSTE，90 L10％ SDS，10,／L 收稿 日期 ：2008—02—26 基金项 目：浙江省杭州市科技计划资助项 目16)． 作者简介 ：冯晓宇(1962～)，男 ，浙江杭州人 ，硕士 ，副教授 ，主要从事水产苗种 的繁育、健康养殖和种质特性研究 8O 西南大学学报 (自然科学版) 投稿 网址 http：／／xbgjxt．swu．edu．cn 第 3O卷 20mg／mL蛋 白酶 K，56℃至消化完全 ，加苯酚 ：氯仿 ：异戊醇 (25：24：1)抽提 1～2次，再加氯仿 ：异 戊醇抽提 1次 ，上清液采用 2倍体积无水乙醇沉淀，4O LTE溶解 ，电