投影边缘在硝基苯类化合物构效关系研究中的应用.pdfVIP

V o l. 25 高 等 学 校 化 学 学 报 　 N o. 4　 2 0 0 4 年 4 月 　　 　　　　　CH EM ICAL JOU RNAL O F CH IN E SE UN IV ER S IT IE S　　　　　 　　 622～ 626　 投影边缘在硝基苯类化合物构效 关系研究中的应用 张庆友, 齐玉华, 王　俊, 罗操操, 许　禄 ( 中国科学院长春应用化学研究所, 长春 130022) 摘要　在三维投影的基础上, 对投影的边缘进行了描述, 并以其进行了定量结构活性相关研究. 实验结果表 明, 与A m 指数、指示变量和量化参数相结合, 可使其数学模型得到明显提高. 通过人工神经网络对硝基苯 类化合物的毒性进行预测, 结果令人满意. 关键词　硝基苯类化合物; 构效关系; 投影边缘; 多元线性回归分析; 人工神经网络 中图分类号　 652. 7　　　　文献标识码　 　　　　文章编号　025 10790 (2004) O A 化合物结构活性相关性(Q SA R ) 研究的基本假设是化合物的活性与结构之间具有相关性, 由此 可构造一数学模型去表征这种相关性. 其关键环节是如何对化合物进行描述. 近年来, 发展起来一些 ( ) [ 1 ] [2 ] 三维 3 方法 , 即在 3 空间提取化合物的特征来构造对未知化合物的预测模型. 我们 曾 D Q SA R D 开展了在 3 直角坐标系统中投影面积的研究. 以投影面积作为 中的参数, 其缺点是不同的投 D Q SA R 影形状可以具有同样的面积. 为此, 在已有工作的基础上, 我们进行了投影边缘算法的研究. 结果表 明, 以边缘为参数比以投影面积为参数所得到的预测结果要好. 本文给出投影边缘的描述方法. 1　方　　法 1. 1　分子在 3 直角坐标系中的投影 D 为了能够以点编码来表征分子, 首先要计算出化合物的三维坐标, 然后将该分子置于某一密度 ( ) 本文为每纳米 40 点 的三维网格空间, 其中, 分子中的原子以三维坐标及范德华半径来表征. 我们在 美国SG I 公司的 Indy 工作站上, 用 T r ipo s 公司的Syby l 6. 1 对化合物的构象进行优化, 得到了分子的 三维坐标. 为了进行分子间的比较, 分子在三维空间的取向必须一致, 即需要对分子进行重叠. 通常, 采用两种方式进行重叠: 一种是以分子的刚性部分进行重叠, 另一种是按化合物的关键基团进行重 叠. 本文重叠分子的刚性部分