SARS相关病毒基因组序列研究.pdfVIP

损伤，肺部及免疫系统是病毒主要作用的靶器官，肺部广泛性实变，大量透明膜形成，呼吸窘迫及免疫功 能低下是本病死I’：的j．要原凶。 参考文献[略] PS一()6 SARS相关病毒基因组序列的研究 来茂德谷雪梅 浙江大学医学院病理学教研室(杭州310031) Acute 严重急性呼吸道综合征(Severe Respiratory 世界卫生fltf){(WorldHealth 的协作监测网络，围绕SARS的各方面，全面展开研究工作(http：／／www 香港大学率先宣布分离出引起SARS的一种未知冠状病毒后，世界各地包括加拿大、美国、新加坡、中国 相关冠状病毒(SARS ColumbiaCancerCenter Genome metaDneumovirus)使病情恶化。自4月中旬加拿大BCCA(BritishAgency CentreforDiseaseControlandNational SciencesCentre．BritishColumbia Microbiology for and CentersDiseaseControl 和美国CDC(National 序列达到88条，其中全基因组序列仍为14条(表1)。 1． SARS相关冠状病毒(sARsCoV)概述 ssRNA DNA viruses，no positive—strand 病毒目)；Coronaviridae(冠状病毒科)；Coronavirus(冠状病毒属)；SARS 所特有的重要结构特征：即RNA A尾结构。该结构是冠 5’端的甲基化帽(methylatedcap)，3’端的Poly 状病毒基因组RNA自身即可发挥翻译模板作用的重要结构基础。目前完成的SARSCoV的全基因组序列 新发现的冠状病毒，美、加、中三个国家的研究组在发表各自基因组分析结果的同时，对SARSCoV进行 CoV与以往任何已经 了系统发生学的分析(phylogeneticanalyses)阻”，均得出了相同的结论，即SARS 确定的冠状病毒并不同，在系统发牛上与其他冠状病毒成员基本上是等距的，属于冠状病毒科中独立的第 4群(图1，表2)141o但Eric等”’将SARSCoV与冠状病毒属的其他病毒，以及同为冠状病毒科的环曲病 tree)分析发现，SARS 毒属病毒(Torovirus)进行Rooted系统树(rooted CoV为冠状病毒科 phylogenetic 的第．群的远端分支，与鼠肝炎病毒(MHV)最为接近。该发现同香港大学4月份的报道是一致的…。虽 然SARSCoV在分类学七的最后位置还存在争议，从基因组、生物学、遗传学和临床资料看，该病毒为彳i 74 同以往所认识的一种今新的冠状病毒，是毫无疑问的。 2． SARS CoV的基因组结构特征 readingframe，ORF)”“1；在5’端和3’端分别含有甲基化帽和PolyA尾巴。如前所述，其基因组结构符 合典型的冠状病毒特征，含有在所有冠状病毒中保守的同源蛋白的编码基因序列。除5’和3’两端很短的非 编码序列区(untranslated 构蛋白。这些非结构蛋白在不同的冠状病毒中变异很大，在已有蛋白质序列数据库中未找到任何同源的蛋 u