当前中药数据库建设中的几个问题.pdfVIP

1No．3 2009第十一卷第三期kV01．1 摘 要：简要回顾了中药信息学的发展历程，通过与化学信息学等学科的比较，在建设信息学类 型的中药数据库、中药数据的计算机化存储格式和中药传统药效的处理方法等方面进行了深入探 讨，提出了一些建议。 关键词：中药数据库 中药信息学 计算机技术的飞速发展，为科学技术提供了前 在几年的时间里，中药信息学研究在中药数据 所未有的强大计算动力，使原来靠人力不可能实现 库的建设、中药指纹图谱的计算机化、中药数据库的 的演算工作成为可能，也使原来一些因计算量过于 知识发现研究、中药组效关系研究、中药实体语法系 庞大而无法使用的数学方法有了用武之地。因此，以 统等方面取得了很多町喜的成果【ll～31。但另一方面， 计算机为主要工具的现代信息学在应用复杂数学方 在发展的过程中一些问题逐渐显现出来，需要全体 法分析海量数据方面具有先天的优势Ⅲ。从20世纪 中药信息学研究人员共同努力，寻找解决的途径。 70年代开始，出现了一批信息学与传统科学结合的 一、建设信息学意义上的中药数据库 交叉学科，如化学信息学，生物信息学等。中药信息 学也是在这样的背景下产生的。 对于化学、生物学、药学等领域的研究者来说， 中药信息学一词最早在上世纪末零星出现一些 数据库已经成为获取科研情报一个重要渠道。而对 学术刊物上∞I，2003年以后受到化学信息学和生物化学信息学、生物信息学和药物没计等领域的人，如 信息学蓬勃发展的影响，中药信息学开始受到中药 果脱离了各种在线数据库和商业数据库的数据支 界的广泛关注限¨】。另一方面，在中药现代化研究过程 持，要开展工作是不可想象的。数据库是信息学研究 中，人们逐渐认识到，中药的作用机制具有系统层面 的基石，只有基于数量大、质量高、格式规范的数据， 上的复杂性，使用传统方法很难触及到中药“多成 并使用适合的数据分析算法，才有可能得出新颖、可 分，多途径，多靶点，整体调节”的实质。如果将信息 靠的结果。对于中药信息学这样一门还没有太多积 学中的数据分析方法引入到研究中来，有可能达到 淀的新兴信息学科，在很长的一段时间内，应对数据 事半功倍的效果。 库建设予以足够的重视。 目前国内多家单位建立起具有不同特色的中药 收稿日期： 2009-03-25 数据库，其中具有代表性的有上海创新中药研究中 修回日期： 2009—05一16 ★ 会副主任委员．中国工程院院士。 andMateria and TraditionalChineseMedicine 339[World如weTechnology／Modernizationof Medica] 万方数据 世界科学技术一中医药现代化★专论 料毫享化，经过标引后， ：一一： 一：： ．_墨!．望．笔孥警!垄鲨一一 一． 鬟季票翟徽嚣弓差主茎孝i；_{薹爹孑≥ii；乏—篓三三：————萎蓁蓑豪享藤 羹毒j霁釜萋霎曩禺萎黼搿∥种撕究…擗 差辜孚瓣主≯ 蕞勰萎翥妻倒…台嚣…啪耩篆警库篓-?-台掰慧然嚣 嚣霎箸器?具锨高……虚中国科学院过程工烹业差据怂-雕薯曩。嚣滁戮 的实燃l黼种数帕惜张库茹薪臌租磊瑟菡：巢瓣转瓣 据库属于图书馆学范畴， 。。～；。。+ 收录多个国家和组织的涉及中药 或者说经典信息学范畴， 著委羹荤药物专北京东方灵盾公司 在线数据库