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mRNA差别显示技术分离草菇低温诱导基因.pdf
维普资讯
菌 物 系 统 20 3‘):342-346. 2001
Mycosystema
mRNA差别显示技术分离草菇低温诱导基因
陈明杰 谭 琦 曹 晖 王 南 。 黄为一 潘迎捷
南京农业^学资环学院 南京 201100: 农业部食用菌遗传育种重点开放实验室.上海市农业遗传育种重点开放实验室
上海市农业科学院食用菌研 究所 上海 201106)
摘要:本文报 道采用改 良的mR~NA差别筛选}去.通过选用 3’锚定引物和 18.25碱基的 PCR随机 引
物组合,以琼脂糖凝胶 电泳,EB 显色替代聚丙烯酰胺凝腔电泳和放射 自显影,对低温处理草菇
(Volvarieltavolvace 及正常草菇基因表选进行筛选、分析,结合 ILNA斑点杂交技术加 以验证,分
离得到7O个草菇低温诱导 DNA片段:
关键词:草菇;mlLNA差别筛选法 低温诱导
中国分类号 :093996 文献标识码 :A 文章编号:1007—3515(2001)03—0342-0346
1992年 Liang和 Pardeg根据高等生物成熟 的mRNA都带有 polyA的特性 ,用特定的锚定引
物反转录后 ,进行 PCR扩增,建立了mRNA差别显示技术(mRNA differentialdisplay, mRNA
DD.PCR)(Liang,1992) 目前 已经报道用该技术发现 的新基因超过 300个,显示 了它 的优越性和
良好的发展前景f叶纨芝 1999)
Liang等所建立 的DD.PCR技术用 6%的测序聚丙烯酰胺凝胶 电泳,扩增时要加入 同位素,还
要放射 自显影 ,因此实验周期长、成本高、易造成环境污染,实验 的限制 因素较多;本文通过对
PCR 引物的改良,用琼脂糖凝胶 电泳,EB显色替代聚丙烯酰胺凝胶电泳和放射 自显影,使得工
作大大简化。应用这一技术,分离得到70个草菇低温诱导 DNA片段 。
1材料与方法
1.1 供试草 菇殛其草菇菌株
草菇(Volvarieflavofvacea)V23采 自上海草菇产地南汇县 草菇菌株V23由供试的南汇草菇中
经组织分离获得,并由本所菌种保藏 中心保藏。
1.2 草菇菌丝体培养
草菇菌株接入 PDY液体培养基 (马铃薯 20%,葡萄糖 2%,酵母提取物 O.1%),32℃恒温静止培养
5d后,一部分草菇菌丝在 4℃低温分别处理 1、2、3、4h。用 400目的滤网过滤收集草菇正常菌丝
和低温处理菌丝,菌丝用无菌蒸馏水冲洗数次,用滤纸吸干水分,于.70~C冷冻 2h后 ,在 T=.55
℃、P=3×l00mba的条件下,于冷冻干燥机 (EDWARDS,英 国)中冷冻干燥 24h,得到草菇样
品的干燥菌丝 ,于.70C保存
1.3 草菇蓖丝体总 RNA的制备
采用 TRIzol试剂 (上海 华 舜生物 工 程有 限 公司 )对草菇样 品进行 RNA 制各 。提纯的
RNA利用 RQ1RNase.FreeDNase(Prornega)去除 DNA,得到纯化的 RNA。
奉项 目由上海市科学技术发展基盘资助.项 目编号:00392【076
收原稿 日期:20014)l-30-收修改稿 日期:200L-03—29
现 在通 讯地址 :农 业都食 用菌遗 传育种 重点 开放 实验 室.上海 市 农科院食用菌 研究所 .上 海南华 路 35 号.Email:
mingiiechen@chinac0m
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三旦 — — 陈明杰等:mRNA差别显示技术分离草菇低温诱导基因 343
1.4 mRNA差别筛选法
1.4.1cDNA合成: eDNA 合 成 反应 总体 积 为 20pl,其 中含 有 50mmol/L Tris.HCI,DH8. 3:
75mmo1/LKCh 3mmol/L MgCIzl0mm0LDTT:0.2mmol/L dNTP:25UnitR_N,A 酶抑制剂
(Promega)~l山50mmol/L反转录锚定引物 (生工);20Un
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