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一种改进的谱聚类算法及其在基因表达谱分析中的应用.pdf

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一种改进的谱聚类算法及其在基因表达谱分析中的应用.pdf

2012 9 ( ) September 2012 年 月 安徽大学学报 自然科学版 36 5 Journal of Anhui University (Natural Science Edition) Vol. 36 No. 5 第 卷第 期 一种改进的谱聚类算法 及其在基因表达谱分析中的应用 1 1* 2 , , 葛 芳 王 年 郭秀丽 (1. , 230039 ;2 . , 250011) 安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室 安徽合肥 山东省信息中心 山东 济南 : . 摘 要 聚类分析是从基因表达谱数据中提取生物医学信息的主要方法之一 针对传统谱聚类算法 , . 无法确定聚类个数的问题 提出一种改进的谱聚类算法并将其应用于基因表达谱聚类分析 首先用基因 Laplacian , , 表达谱数据构造 矩阵 经特征值分解后得到相应的特征值和特征向量 用谱隙来描述相邻特 ; ; 征值的差值 然后通过寻找谱隙序列的最大值来确定聚类个数 最后从单位化的特征向量着手实现数据 . , . 类别的划分 通过模拟数据与癌症数据的实验 证明了该文算法的有效性 : ; ;Laplacian ; 关键词 谱聚类 谱隙 矩阵 基因表达谱 中图分类号:TP 18 文献标志码:A 文章编号:1000 -2162 (2012)05 -0067 -06 An improved spectral clustering algorithm and its application in gene expression profile analysis GE Fang1 ,WANG Nian1* ,GUO Xiu-li2 (1. Key Laboratory of Intelligent Computing and Signal Processing ,Education of Ministry ,Anhui University , Hefei 230039 ,China ;2 . The Information Center of Shandong Province ,Jinan 250011,China) Abstract :Cluster analysis is one of the main methods for extracti

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