肠球菌随机引物扩增DNA多态性地分型研究.pdfVIP

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肠球菌随机引物扩增DNA多态性的分型研究 首都医科大学附属北京友谊医院检验科(100050)刘淑梅许淑珍 北京大学人民医院检验科张正王贺 首都医科大学附属北京同仁医院检验科董云秋 北京大学第一医院检验科张敏 肠球菌是引起医院感染的重要病原菌之一。由 6.PCR模板的制备:基因组DNA提取见参考文 于其多重耐药,而且对抗生素耐药性逐年增加,给临 献。 床治疗选药带来困难,故追踪其传染源、控制其感染 7.随机引物及PCR反应条件:从RAPD试剂盒 已成为当务之急。随机扩增DNA多态性技术20条引物中筛选出1条最佳引物进行试验,引物序 (RAPD)是一种以PCR技术为基础的DNA指纹图谱 鉴定技术,本文采用该技术对临床分离的肠球菌进 unit/td),10 X DNA聚合酶1阻(1 X缓冲液2出,(10 行RAPD基因分型,了解北京地区多重耐药肠球菌 500 缓冲液由以下成分组成:KCl mmol/L;riffs.HCl RAPD基因分型情况,探讨RAPD分型法在肠球菌引 100 mmol/L;Triton mmol/L);dNTP$ X一100;MgCl:20 起的院内感染研究的临床应用。 0.5ILl(10 mmol/L)(250/maol/L);引物1.0tmaol/L,模 min 材料和方法 板4出,双蒸水补足至20出。经94℃预变性3 后,再经94℃lmin,350C2min,72。C2mln,45个循环, 1.菌株来源:2001年1月至2003年12月北京 72。C延伸10min。扩增产物于1.8%琼脂糖凝胶中 4家教学医院的细菌室从痰、尿、血液等标本中分离 V2 电泳,电压50 h,溴化乙啶染色对PCR产物进行 的不重复肠球菌340株,其中首都医科大学附属北 检测。 京友谊医院(Y)100株,北京大学人民医院(R)80 8.RAPD实验条件的优化:将模板原液作10、 株,北京大学第一医院(B)80株,首都医科大学附属 100、1000倍稀释,用于扩增。将引物稀释为0.25、 北京同仁医院(T)80株。质控菌株:粪肠球菌 0.5、1、2,4 panol/L浓度。退火温度分别采用30、33、 ATCC29212。ATCC51299。 DNA聚合酶稀释为0.5、1、

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