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肠球菌随机引物扩增DNA多态性的分型研究
首都医科大学附属北京友谊医院检验科(100050)刘淑梅许淑珍
北京大学人民医院检验科张正王贺
首都医科大学附属北京同仁医院检验科董云秋
北京大学第一医院检验科张敏
肠球菌是引起医院感染的重要病原菌之一。由 6.PCR模板的制备:基因组DNA提取见参考文
于其多重耐药,而且对抗生素耐药性逐年增加,给临 献。
床治疗选药带来困难,故追踪其传染源、控制其感染 7.随机引物及PCR反应条件:从RAPD试剂盒
已成为当务之急。随机扩增DNA多态性技术20条引物中筛选出1条最佳引物进行试验,引物序
(RAPD)是一种以PCR技术为基础的DNA指纹图谱
鉴定技术,本文采用该技术对临床分离的肠球菌进 unit/td),10 X
DNA聚合酶1阻(1 X缓冲液2出,(10
行RAPD基因分型,了解北京地区多重耐药肠球菌 500
缓冲液由以下成分组成:KCl mmol/L;riffs.HCl
RAPD基因分型情况,探讨RAPD分型法在肠球菌引
100
mmol/L;Triton mmol/L);dNTP$
X一100;MgCl:20
起的院内感染研究的临床应用。
0.5ILl(10
mmol/L)(250/maol/L);引物1.0tmaol/L,模
min
材料和方法 板4出,双蒸水补足至20出。经94℃预变性3
后,再经94℃lmin,350C2min,72。C2mln,45个循环,
1.菌株来源:2001年1月至2003年12月北京
72。C延伸10min。扩增产物于1.8%琼脂糖凝胶中
4家教学医院的细菌室从痰、尿、血液等标本中分离
V2
电泳,电压50 h,溴化乙啶染色对PCR产物进行
的不重复肠球菌340株,其中首都医科大学附属北
检测。
京友谊医院(Y)100株,北京大学人民医院(R)80
8.RAPD实验条件的优化:将模板原液作10、
株,北京大学第一医院(B)80株,首都医科大学附属
100、1000倍稀释,用于扩增。将引物稀释为0.25、
北京同仁医院(T)80株。质控菌株:粪肠球菌
0.5、1、2,4
panol/L浓度。退火温度分别采用30、33、
ATCC29212。ATCC51299。
DNA聚合酶稀释为0.5、1、
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