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禾谷镰刀菌基因组中含寄主靶向模体分泌蛋白功能的初步分析_于钦亮.pdf
生物技术通报
·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期
2008 1
禾谷镰刀菌基因组中含寄主靶向模体分泌蛋白功能的初步分析
于钦亮 马莉 刘林 杨静 苏源 王云月 朱有勇 李成云
(云南农业大学教育部生物多样性与病虫害控制重点实验室,昆明 )
650201
摘 要: 基于生物信息学的方法,以 、 、 和 四个分析软件
SignalPv3.0TargetPv1.01Big-PIPredictor TMHMM v2.0
对禾谷镰刀菌( )全基因组的 个蛋白编码基因的 端氨基酸序列进行信号肽分析,
FusariumgraminearumSchw. 11640 N-
预测出606个潜在的分泌蛋白编码基因。通过对这些潜在的分泌蛋白进行MEME软件分析,发现其中有 157个分泌蛋白
的剪切点下游 氨基酸残基范围内具有一个保守的 模体,其中有 个分泌蛋白具有可预测的功能性描述,包
120 RXLX 79
括 具有与草酸盐氧化酶 有关的功能, 具有与 , 葡糖苷酶葡聚糖有关的功能,这些基因可作
FG00023.1 1 FG01588.1 14-α-
为禾谷镰刀菌致病相关的候选基因。其中FG04097.1编码的具有与丝氨酸型蛋白酶有关的功能在致病疫霉和疟原虫真
核寄生物中具有相似保守的寄主靶标模体的效应蛋白中也观察到,但 , 编码的蛋白尚未被证明参与
FG09127.1FG05287.1
致病过程的研究报道。深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用禾谷镰刀菌基因组学研
究成果,结合计算机技术和生物信息学的方法,分析其分泌蛋白组学,将有助于全面掌握其致病因子的结构与功能。对于
这些蛋白功能的比较研究,将有利于对禾谷镰刀菌致病性的分子机制的探索,并为设计新的防治措施提供理论依据。
关键词: 禾谷镰刀菌 分泌蛋白 生物信息学 寄主靶向模体
PrimaryAnalysisofHost-Targeting-motifHarboredSecreted
ProteinsinGenomeofFusariumgraminearum
YuQinliang MaLiLiuLin YangJing SuYuan WangYunyue ZhuYouyong LiChengyun
( ,
TheMinistryofEducationKeyLaboratoryforAgriculturalBiodiversityForPestManagementYunnanAgricultural
, )
UniversityKunming650201
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