生物信息学 第十一章.docVIP

11 利用蛋白质序列的预测方法 Andreas D. Baxevanis Genome Technology Branch National Human Genome Research Institute National Institutes of Health Bethesda. Mryland David Landsman National Center fro Biotechnology Informaiton Computational Biology Branch National Library of Medicine National Institute of Health Bethsda. Maryland 本书对数据库的讨论及前几章中提供的信息都说明，当前各种公共数据库中的序列信息的数量正急剧增加。与我们已知的核酸序列一样，所有蛋白质序列，无论是直接测得还是由核酸序列中的开放阅读框转换而来，都包含有决定其结构功能的内在信息。可惜用实验方法获取这些信息的速度远远赶不上单纯序列数据产生的速度。象圆二色谱、旋光色散、X光晶体衍射和核磁共振都是确定结构特征的强有力技术，但它们的实现需要大量时间，并对技术和技巧都有很高要求。对比蛋白质序列和结构数据库的容量可知两类信息之间差距已十分明显，到写这本书时，有428,814个条目在冗余的蛋白质序列库（nr），而PDB库中仅