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十字花科黑腐病菌六个小RNA的功能鉴定
摘要
RNA,简称ncR_NAs)。
RNA分为编码RNA和非编码RNA(英文全称non-coding
小RNA的探索热潮,因为小RNA已经被发现对细菌的各种代谢过程甚至包括致病过程有
重要的作用。本课题组致力于研究十字花科黑腐病菌(Xanthomonas
sRNA-Xcc22、sRNA-Xcc23、sRNA-Xcc24的功能进行鉴定。
为了研究这些小RNA的功能,我们拟通过这样的技术路线:构建它们的过量表达
菌株和缺失突变体并进行表型分析。
目前,我们完成了这六个过量表达菌株以及一个缺失突变体的构建,根据它们过量
进行了碳源利用、金属离子耐受性、蛋白质变性剂、胞外酶及胞外多糖、致病性、过敏
性、游动性等多方面的多种表型分析。结果显示,其中2个过量表达菌株和Xcc8004以
及Xcc8004p相比在几个方面分别有较明显的表型变化—OE23的胞外蛋白酶的分泌显
失;其他五个菌株的各种表型与Xcc8004以及Xcc8004p相比都没有明显的差异。
个小RNA是否不参与相关的代谢过程,是否不和致病相关,都需要进一步的实验论证,
包括构建其余五个小RNA的缺失突变体以及对应的互补菌株。
关键词:小RNA高通量测序过量表达菌株
表型缺失突变体
Ⅱ
0FSⅨSMALLRNAIN
FUNCTIoNALANALYSIS
XANTHOMONASCAMPESTRIS
ABSTRACT
small to RNA isbetween
sRNAs(Bacterial length
RNAs),belongsnocodingfamily.It’S
in
40—500nt.sRNAsisfoundto metabolismbacterialresent
participatemany progress years.
Withthefast of andmoresRNAsof
developmentHigh-throughputsequencing,more
Xanthomonas 8004areidentifiedinourlab.
campestris(Xcc)strains
campestrispathovar
This isto theructionofsRNAswhichwenanlesRNA-Xccl
job study 9,sRNA-Xcc20,
sRNA-Xcc2
1,sRNA-Xcc22,sRNA-Xcc23,sRNA-Xcc24.
We
constructofsixsRNAs strains”andone”mutantdeletion
genes”overexpression
strain”andnamethemOEI 9.
9,OE20,OE21,OE22,OE23,OE24,DMl
show andOE24h
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