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苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系研究_医学论文.doc
苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系研究_医学论文
苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系研究_医学论文
【摘要】 目的 探讨苏云金芽孢杆菌(Bt)与蜡状芽孢杆菌(Bc)的亲缘关系,为Bt鉴定、安全性评价及降低其致病风险等提供科学依据。方法 采用肠杆菌基因间重复一致序列-PCR(ERIC-PCR)技术,对6株苏云金芽孢杆菌和3株蜡状芽孢杆菌及对照菌株的基因组DNA进行扩增,对其指纹图谱进行分析;回收并克隆重复性好的苏云金芽孢杆菌基因组DNA扩增片段,以其为探针,分别与供试菌株基因组DNA进行杂交。结果 与蜡状芽孢杆菌相比,苏云金芽孢杆菌菌株间基因组DNA指纹图谱较一致;所有供试苏云金芽孢杆菌菌株均扩增产生一条250bp左右的片段;苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌均可扩增产生600bp左右的共有DNA片段。此外,以苏云金芽孢杆菌500bp片段为探针与苏云金芽孢杆菌基因组DNA杂交有很好的特异性。结论 肠杆菌基因间重复一致序列-PCR指纹图谱可以正确反映苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系;500bp片段可以作为苏云金芽孢杆菌鉴定探针。
【关键词】 苏云金芽孢杆菌
苏云金芽孢杆菌 (Bacillus thuringiensis,Bt)与蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus,Bc)同属于蜡状芽孢杆菌菌群,为自然界中广泛分布的革兰阳性菌〔1〕。其中Bt在其休眠期可形成对昆虫有毒性的伴胞晶体。因此,被作为生物杀虫剂广泛应用于农业及卫生害虫的生物防治;Bc则是人畜条件致病菌,可导致人食物中毒和感染,引起呕吐和腹泻〔2〕。研究表明,在自然环境中,两者染色体体外遗传物质可以出现高度重组〔3〕,在DNA水平也具有较高的同源性,只有个别碱基有差异〔4〕。由于Bt与Bc的相似性,许多细菌分类学家认为Bt与Bc应为同一个种〔5〕。Bt和Bc间的同源性关系,使Bt安全性问题越来越受到人们重视。因此,为研究两者的亲缘关系,对Bt的鉴定、Bt应用的安全性评价,以及进一步提高Bt杀虫效力、降低其致病风险,本文利用肠杆菌基因间重复一致序列(ERIC)-PCR技术〔6〕对Bt和Bc全基因组DNA进行扩增,对获得的Bt和Bc基因组DNA指纹图谱进行分析,探讨Bt和Bc起源进化关系,同时筛选并克隆了Bt基因组DNA扩增片段,对应用ERIC-PCR技术鉴别、鉴定Bt和Bc进行可行性探讨。结果报告如下。
1 材料与方法
1材料
1菌株 Bt 6株(菌株号为CGMCC 11749、CGMCC 1、CGMCC 1、CGMCC 1、CGMCC 1、CGMCC 1),Bc标准株1株(菌株号为CGMCC 1),大肠埃希菌、枯草芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌等对照菌株各1株(菌株号分别为CGMCC 1、CGMCC 1和CGMCC 1)〔购于中国普通微生物菌种保藏中心(CGMCC)〕,Bc分离株2株为沈阳出入境检验检疫局分离,并经国标生化鉴定。
1引物及试剂 (1)ERIC引物: 由大连TaKaRa生物工程有限公司合成,引物序列分别为: PrimerⅠ:5′-ATGTAAGCTCCTGGGGATTCAC-3′,PrimerⅡ:5′-AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCG-3′;(2)试剂:Ex-Taq酶、IPTG、X-gal(大连TaKaRa生物工程有限公司);pGEM-T vector连接转化试剂盒(pGEM-T vectorSystem Ⅱ)及JM109高效率感受态细胞(美国Promega公司);放射性同位素〔α-32P〕-dCTP和随机引物DNA标记试剂盒(Random Primer DNA Labeling System,英国Biolabs公司);尼龙膜及3MM滤纸(英国Whatman公司);其他试剂为本实验室自配,均为分析纯。
1方法
1菌株培养及其基因组DNA的提取 斜面活化的菌株在LB 培养基中30℃摇床培养过液(200r/min) ,离心收集2ml 培养的菌体(4000r/min ,10min ,20℃) ,采用实验室常规酚/氯仿法提取各菌株基因组DNA。所提取DNA经Beckman DU~640检测,吸光度A260/A280值在1~1之间,纯度符合PCR扩增条件。
1反应条件及结果鉴定 (1)反应体系组成和反应条件:依据文献方法〔7〕。PCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳(U=3V/cm;T=100min)。DNA标准分子量为DL2000,PCR产物经溴化乙锭(EB)染色后在凝胶成像系统上照相。
1产物回收与克隆 将上述扩增产物利用1琼脂糖凝胶电泳分离。选取重复性好的Bt基因组DNA扩增片段,使用DNA凝胶回收试剂盒进行回收、纯化。纯化产物连于pGEM-T载体,转入JM109感受态大肠埃希菌。连接反应、转化操作以及克隆子的鉴
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