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多重RT-PCR快速检测禽流感病毒地研究.pdf

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第五届中南地区实验动物科技交流会 论文汇编 多重RT—PCR快速检测禽流感病毒的研究 乔宪风,陈思怀,华文君,郑新民.魏庆信,刘西梅,周荆荣 【摘要】参考HI—H15亚型禽流感病毒(AIV)的核蛋白(NP)基因序列以反 m,H6,H9亚型AIV血凝素(HA)基因共设计四对引物,建立了用两对引物扩螬AIV 囊液、新城疫病毒(NDV)、传染性支气管炎病毒(IBV)、传染性法氏囊病毒(IBDV)尿 囊液以厦三种亚型AIV尿囊液的2倍系列稀释样品进行RT—PcR并电泳检测。结果 表明,对三种亚型AIV尿囊液扩增均出现两条特异性条带,经测序确证为目的扩增片 段,说明该方法能检测此三种亚型AIV;对NDV、IBV、IBDV的RNA扩增未见目的条 带,判断为阴性,说明该法特异性强;能对三种亚型AIV尿囊液64—128倍稀释的样品 检测出AIV。表明灵敏度高。谊检测法检测的整个过程仅需4小时,实现AIV的快速 检测。 【关键词】禽流感;RT—PCR;诊断 禽流感对养禽业、人类公共卫生安全的严重威胁,因此倍受人们的关注…。为了尽早、准确的诊 Influenza 断本病,检测禽流感病毒(Avian Virus,AW)是关键。传统诊断方法有病毒分离、电镜观察、 足,如:检测周期长、灵敏度不高、特异性不强、不能检测病死材料以及不适台对活禽市场环境和进出 口畜禽产品的大样本检测。随着现代分子生物学的发展,聚合酶链式反应(PCR)或反转录一PCR (RT—PCR)技术的应用实现AIV检测的快速、准确、灵敏。同时能对PCR产物的序列分析,便于对 —PCR反应主要根据扩增单基因进行AIV型或亚型诊断,目前未见报道在同一RT—PCR反应中作 出型和亚型同时诊断。本研究主要针对NP(型诊断)、HA(亚型诊断)基因建立两对引物多重RT— PCR检测方法,对我国主要报道的H5、H6、H9亚型AIV快速检测。 l材料与方法 1.1主要仪器及试剂 1.2病毒增殖对湖北畜牧兽医研究所保存的H5N1、H6N2、H9N2 AIV,新城疫病毒(NDV)、传染 的活胚的尿囊液。50009离心10rain,-20T:冻存。 170 论文汇编 第五届中南地区实验动物科技交流套 表1合成的引物序列 注:R=A/C,Y=C/T,M=C/C,W=A/T,K=G/T I.4 RNA加人75%乙醇,-20。C保存。 1.5 产物(eDNA)进行扩增。并调整反应条件和优化反应体系。 1.6 PCR产物判断对PCR产物琼脂糖凝胶电泳,根据片段大小初步判定,回收预期条带( 粒,进行测序(上海搏亚公司完成),并与Genebank注册序列BLAST。 向引物,PCR引物为4对引物的混合;阳性对照以4种经测序确证的阳性质粒等量混合为PER模板, 用4对引物的混合扩增。 别对H5、H6、H9AIV进行交叉RT—PCR检测,反应条件及体系同步骤1.5。 1.9灵敏度实验将三种亚型禽流感病毒尿囊液作2的倍比稀释,对每一稀释样品进行检测,其余 步骤同I.4,1.5。 2结果 2.1 RT—PCR反应 经多次调整反应条件,优化反应体系,按表2的条件体系可得到较好的检测结果。三组多重 H9条带,阴性无条带.NP、H5、H6、H9四条带同时清晰出现在阳性对照泳道,见图I。 17l 第五届中南地区实验动物科技交流套 论文汇编 图1对三亚型AIVRT—PCR产物电泳图 1Mmkcr 5阴性对照6阳性对照 2,3,4分别为H5,H6,

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