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生物医学文本中命名实体识别研究.pdf
第28卷第2期 上海交通大学学报(农业科学版) V01．28N。．2
2010年4月 OFSHANGHAI
JOURNAL JlAOTONGUNIVERSITY(AGRICULTURALSCIENCE) Apr．2010
文章编号：1671-9964(2010)02-0132-08
生物医学文本中命名实体识别研究
张向撼，王明辉，赵洪波，王起山，潘玉春
(上海交通大学农业与生物学院，上海200240)
摘要：生物命名实体识别是对生物医学文本进行信息处理的关键技术。准确的生物命名实体识别工具是对文本进行后续工
作如信息提取或文本分类等的先决条件。经过多年的研究，生命科学领域生物命名实体识别取得了一定的进展。本文总结了生
物命名实体的特征，分析了基于不同方法的生物命名实体识别系统，及生物命名实体识别方法在提取蛋白质互作等方面的丰
富应用，并展望了未来的发展趋势．
关键词：生物信息学；生物命名实体识别；生物医学文献
1．4 文献标识码：A
中图分类号：G202；Q81
ResearchonNamed from
EntityRecognition
BioremoieruedicaltaretiL tterature
ZHA NG
NG 0 NG NYu-chun
Xiang-zhe，WAMing-hui，ZHAHong-bo，WAQi-shan,PA
of and
(SchoolAgricultureBiology，ShanghaiJiaotongUniversity，Shanghai200240，China)
of
named isa biomedicaltext Bio-NERtools
Abstract：Biologicalentityrecognition(Bio-NERlkeytechnology processing．Precise
a弛a for ontext．such鹅informationextractionordocumentclassification．Overthe
prerequisitemanyapplicationsworking pastyears
ofresearch．NERhasnltldesome inthelife this namedentitiesa弛de-
sciences．In characteristicsof
progresses paper,the biological
variantmethods mostBio-NER aviewofthefutureofBio-NER
scribed，the sketched，and
underlying systems given．
named literature
Keywords：bioinformatics；biologicalentityrecognition；biomedical
随着计算机的普及以及互联网和生物相关科学 理和信息技术有信息检索、信息抽取
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