微生物蛋白质组学的定量分析.pdfVIP

· · 生物化学与生物物理进展 ； （） #DD #$%’()%*+,-’()%+0’ ’# 12 # ./ 微生物蛋白质组学的定量分析 王敬强 殷剑宁 刘斯奇! （中国科学院遗传与发育生物学研究所基因组信息学中心，北京 ） !!# 摘要 越来越多的微生物基因组序列数据为系统地研究基因的调节和功能创造了有利条件 由于蛋白质是具有 $ 生物功能的分子，蛋白质组学在微生物基因组的功能研究中异军突起、蓬勃发展$微生物蛋白质组学的基本原 则是，用比较研究来阐明和理解不同微生物之间或不同生长条件下基因的表达水平 显而易见，定量分析技术 $ 是比较蛋白质组学中急需发展的核心技术$对蛋白质组学定量分析技术在微生物蛋白质组研究中的进展进行了 综述$ 关键词 微生物，蛋白质组学，定量分析 学科分类号 %! 在基因组研究热潮的推动下，蛋白质组学正在 期短，取材简单、便宜 这些都是开发分析技术的 $ 从一个符号变成一门蓬勃发展的严肃学科 但是， 理想条件 $ $ 它所面临的技术瓶颈区域却日益尖锐地摆在研究者 蛋白质组定量的概念是试图准确地测定蛋白质 ［］ 面前 ! $因此实现蛋白质组学的技术革命是学科 组间相对含量的差别，而不在于测定其绝对浓度$ 是否健康发展的基本前提$ 根据蛋白质组分析的手段，定量方法可大致分为电 大规模基因组序列测定的目的在于精确地了解 泳定量法和色谱定量法；根据处理蛋白质方法不 某一生物体的基因结构以及基因数量$蛋白质组的 同，又可分为体外标记法 （ ）和体 -(*.-/0 !#!$% 1 分析则着重于阐明某一生物体的某一组织或某一细 内标记法 （ ） -(*.-/0 !#!# $ 1 胞，甚至是某一细胞器在某一时间点上基因表达的 ! 体外标记的电泳定量法 水平 因而，在基因组已经确定的前提下，蛋白质 $ 组分析所关心的问题是基因表达量的 “有与无”或 这种定量法一般采用不同的蛋白质显色剂，将 ［］ ’ 蛋白质组表达差异分析的主要问题 “多与少” $ 电泳分离的蛋白质染成可被肉眼或机器识别的斑 是如何合理地比较蛋白质组之间的差别，即如何分 点，然后运用图像分析软件定量比较斑点的吸光度 析不