氮杂茋衍生物靶向虚拟筛选研究.pdfVIP

第50卷第4期 大连理工大学学报 V01．50，No．4 201 2 0 0年7月 of July 0 l JournalDalian of UniversityTechnology 氮杂芪衍生物靶向虚拟筛选研究 李悦青1， 黄雅俊1， 赵伟杰1， 王希诚q (1．大连理工大学精细化工国家重点实验室，辽宁大连116012； 2．大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室，辽宁大连 116024) 摘要：为寻求新的具有强生理活性的苠类化合物，设计了237个全新结构的氮杂莨小分子． 基于靶标虚拟筛选平台TarFisDock，针对病毒类靶标作广泛筛选，所设计化合物均集中结合 于HIV蛋白酶的活性位点，这一结果已经为HIV蛋白酶正向对接所证实．通过统计所设计 分子的体积、脂水分配系数、小分子一蛋白问氢键，归纳出分子的理化性质与对接结果中结合 能量的关系，并考察了分子结构对能量得分的影响．筛选结果提示HIV蛋白酶可能是氮杂苠 衍生物抑制HIV的高活性靶标． 关键词：氮杂芪衍生物；靶向虚拟筛选；抗病毒 中图分类号：0625文献标志码：A O引言 机辅助药物设计中对接方法，基于TarFisDockt8] 药物靶标虚拟筛选平台，在病毒类靶标中进行靶 芪类化合物是具有二苯乙烯母核结构的化合 向虚拟筛选；在计算机模拟的层面，研究小分子的 物及其聚合物的总称．天然单体芪类化合物的取 一些理化性质对小分子一蛋白相互作用的影响． 代基主要是羟基和甲氧基，取代位置主要在3、5 位，也有4位异戊烯基和2位羧基取代，结构以反 1 小分子设计及筛选方法 式为主，目前至少已在24个科53个属的植物中 1．1小分子设计及准备 发现此类物质[1]．研究发现，芪类化合物具有广泛 本文设计的小分子结构见图1，母核结构中 的抗病毒活性，如抑制人类免疫缺陷病毒(HIV)、 依次用吲哚、吡咯、咪唑环代替一个苯环(分别对 单纯疱疹病毒、巨细胞病毒、T淋巴细胞病毒、流 应图1中的A、B、C三种结构)，同时为了调节分 感病毒和乙肝病毒r2-43等，其中以抑制HIV的研 子的脂水分配系数和体积，在环上引入各类仲胺 究占多数．近年来雷小平等[5、61先后对侧链氨基 取代基、甲氧基、苄氧基、羟基、卤素和烯基等． 取代及氮杂环取代的芪类衍生物进行过合成与活 利用ISIS Draw绘制设计分子的2D结构，并 性研究，结果表明其均具有抑制癌细胞增殖的作 用SPL(Sybylprogramminglanguage)脚本程序 用．李悦青[7]曾设计用吡啶、咪唑、苯并咪唑环替 代母核结构中的一个苯环，合成了一系列氮杂环 分子设计软件包给小分子加全