第六章经验力场模型-分子力学.pdfVIP

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2017-08-17 发布于重庆
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第六章经验力场模型-分子力学.pdf

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6.1 引言 6.1 引言 • ab initio方法— 精确计算分子的电子性质，计 • ab initio方法— 精确计算分子的电子性质，计算量大，对大分子无法计算；第六章经验力场模型算量大，对大分子无法计算；第六章经验力场模型 • 半经验方法— 通过近似，可以用于较大的有机 —分子力学 • 半经验方法— 通过近似，可以用于较大的有机 —分子力学分子，但对更大的如生物分子来说还是不适用；分子，但对更大的如生物分子来说还是不适用； • 分子力学 — 用来研究大分子体系的性质。 • 分子力学 — 用来研究大分子体系的性质。分子力学模型分子力学模型 Molecular Mechanics(MM) Molecular Mechanics(MM) 键伸缩键弯曲键伸缩键弯曲键扭曲键扭曲 Bond Stretching Angle Bending Bond Stretching Angle Bending Torsion(Bond Rotation) 忽略电子运动，采用Newton 力学的方式， Torsion(Bond Rotation) 忽略电子运动，采用Newton 力学的方式，将能量表达成原子核坐标的解析形式而不使用将能量表达成原子核坐标的解析形式而不使用波函数或电子密度。经验力场计算的结果有时波函数或电子密度。经验力场计算的结果有时与最高级别量子力学计算的结果同样精确，而 δδ++ 与最高级别量子力学计算的结果同样精确，而 δδ-- 所耗计算机的时间很少，但分子力学当然不能所耗计算机的时间很少，但分子力学当然不能提供分子中基于电子分布的性质。 δδ++ 提供分子中基于电子分布的性质。非键作用(静电) 非键作用(范德华力) 非键作用(静电) 非键作用(范德华力)