B 细胞表位预测方法研究进展.pdfVIP

第21卷 第2期 生命科学 Vol. 21, No.2 2009年4月 Chinese Bulletin of Life Sciences Apr., 2009 文章编号 ：1004-0374(2009)02-0320-04 B 细胞表位预测方法研究进展 梁　瑾，王靖飞 * (中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室，哈尔滨 150001) 摘　要：B 细胞抗原表位预测方法的研究对基础免疫学的研究及实际应用有着重要的意义。本文归纳了 理论预测 B 细胞表位的常用方法，并对目前预测 B 细胞表位方法存在的问题进行了分析。 关键词：B 细胞；表位；预测 中图分类号：R392.1　　文献标识码：A Progress in the studies of protein B-cell epitope prediction LIANG Jin, WANG Jing-fei* (State Key Laboratory of Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150001, China) Abstract: The studies of protein B-cell epitope prediction play a significant role in the theory of immune recognition and the practical application. In the paper, the several efficient methods for B-cell epitope prediction were summarized and the problems with the method of B-cell epitope prediction were discussed. Key words: B-cell; epitope; prediction 抗体通常特异性地识别抗原蛋白质表面的特定 酸和色氨酸在表位出现频率很高，但缬氨酸出现在 区域，这些区域被称为B 细胞表位[1]。从空间结构 表位的频率几乎为零。Bogan 和Thorn[3]称，酪氨 上看，B 细胞表位可分为连续性的线性表位和不连 酸、色氨酸和带电荷的氨基酸残基之所以多出现在 续性的空间构象性表位。线性表位，是由肽链上顺 蛋白质与蛋白质相互作用界面是由于它们发生相互 序连续的氨基酸组成；构象性表位，是由那些在空 作用的能力比较强。(4)表位的二级结构。表位富含 间结构上接近，但顺序上不连续的氨基酸组成，具 环状结构，而缺失螺旋和折叠结构，因为环状结构 有高度的空间依赖性。表位之所以区别于非表位是 要比其他形式的二级结构灵活，利于抗体的结合。 因为其具有自身的特点，Rubinstein等[2]根据PDB中 表位是蛋白质抗原性的基础，正确而详细地绘 筛选的53个抗原抗体复合物总结了抗原表位区别于 制抗原表位图谱不仅有助于基础免疫学地研究，而 非抗原表位的一些特点：(1)表位分布的大小及范 且对生物活性药物及表位疫苗设计方面也具有重要 围。75% 的表位是由跨越600 —1 000Å 面积的15 的指导意义。 —25个氨基酸组成。(2)与表位结合的抗体的区域。 确定B细胞表位主要有三种方法：X-射线衍射 抗体的互补决定区(