NOD2基因多态与肺结核发病风险在中国人群中的验证性研究.pdfVIP

NOD2基因多态与肺结核发病风险在中国人群中的验证性研究.pdf

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中华医学会结核病学分会2013年学术大会论文汇编 NOD2基因多态与肺结核发病风险在中国人群中的验证性研究 镇江市第三人民医院 潘洪秋戴矗矗唐少文王建明 【摘要】在中国人群中开展的一项麻风病全基因组关联研究发现,免疫相关基因NOD2上四个单核 苷酸多态与中国人群的麻风病遗传易感性有关。由于麻风与结核在病原学和临床特征方面存在诸多相似性, 麻风病全基因组关联研究所发现的易感基因多态可能同样影响结核病的易感性。我们选择1043个肺结核 病人和808例对照开展验证性病例对照研究,所有对照均无肺结核和恶性肿瘤病史,按照性别和年龄与病 人群肺结核病遗传易感性有关。 【关键词】结核;基因多态;易感性;NOD2基因 结核病是全球居民死亡的主要原因之一,对人类健康造成巨大威胁。2010年,全球有大约有800万一 种由分枝杆菌导致的慢性疾病。大约113种结核分枝杆菌,其中结核分枝杆菌和麻风分枝杆菌引起肺结核 和麻风病。全球人151近三分之一的人感染结核分枝杆菌,但只有10%的感染者会发展为活动性肺结核病人。 宿主遗传性差异可以部分解释为什么有些人发病,有些人不发病。近年来,通过候选基因策略与基于通路 的方法, 人们广泛深入研究了遗传基因在肺结核易感性中所起的重要作用。 全基因组关联研究(Genome.WideAssociationStudies,GwAS)是指在全基因组层面上,开展多中心、 大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究,是近年发展起来的寻找与复杂疾病相关的遗传因素的研究方 法。目前,各国科学家在多种复杂疾病和性状中开展了大量的GWAS,对包括肿瘤、糖尿病、心脏病、神 经精神疾病、免疫相关疾病等复杂疾病以及一些常见性状的遗传易感基因研究取得了重大成果[”。加纳和 罕见,目前还未发现在其他人群中有关该位点与结核病发病风险间关联的报导。 在中国人群中开展的一项麻风病全基因组关联研究发现免疫相关基因NOD2基因上4个单核苷酸多态 (SNP)与麻风病的发病风险有关【3J。由于麻风病与结核病在病原学、疾病表现与病程等方面存在诸多一 致性,麻风病全基因组关联研究发现的NOD2基因易感性多态位点可能同样影响结核病的遗传易感性。为 此。我们在中国人群中开展了验证性研究。 中华医学会结核病学分会2013年学术大会论文汇编 I.对象与方法 I.I研究人群采用病例对照研究设计,共纳入在江苏地区收集的1043个肺结核病例和808个正常对 照。肺结核病例中包括809例痰涂片阳性病例和243例痰涂片阴性的肺结核病例。在痰涂片阳性的肺结核 病例中,526例痰标本经L.J培养证实。对照来自于参加当地社区健康体检的一般人群,按性别和年龄与 病例成组匹配。对照组要求无结核病、糖尿病和恶性肿瘤病史。所有的病例和对照均无HIV阳性史。病例 和对照纳入如图1所示。 1.Flowchartofthecaserecruitment. Figure 1.2资料收集所有调查对象均签署知情同意书,采用统+的流行病学问卷调查表,由经培训的调查 员进行进行面访。调查内容包括一般情况、吸烟史、饮酒史、疾病史等,同时采集其静脉血样用于基因分 型研究。 1)。我们对每一个多态位点均进行预实验,每批次384孔板均设有空白对照,并采用盲法进行基因型的判 读,以此保证基因分型的成功率和正确率均95%。 表1.引物和探针设计 等位基因 rs805734l F TGGAGTGAAATGAATGTCCTCAG R GCAAGCCTGACCCTAACCTTTAT Pmbe.TFAM-ATCGl.丌CTn_rCAACTC.MGBAlleleA Probe.CFAM.TCGmCTl℃TC从CTC—MGBAlleleG F GACTCACTCTGGCTGCTGGAT 中华医学会结核

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