2个尼罗罗非鱼群体GHSR基因5＇侧翼序列的多态性及其遗传多样性分析.pdfVIP

第 11卷第 1期 南 方 水 产 科 学 Vo1．11．No．1 2015年 2月 SouthChinaFisheriesScience Feb．．2015 doi：10．3969／j．issn．2095—0780．2015．O1．003 2个尼罗罗非鱼群体 GHSR基 因5侧翼序列的 多态性及其遗传多样性分析 王春晓 ，高风英 ，卢迈新 ，刘志刚 ，朱华平 ，叶 星 (1．中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广东 广州 510380； 2．上海海洋大学水产与生命学院，上海201306) 摘要：该试验以快长尼罗罗非鱼 (Oreochromisniloticus)和普通尼罗罗非鱼2个群体为研究对象，通过 PCR扩增与 测序，获得 GHSR基因5侧翼区序列77条，片段大小为 1217bp。共检测出变异位点57个，包括 12个插入 ／缺 失位点和45个多态性位点。共发现 16种单倍型，其中Hap2可能为原始单倍型。16种单倍型在进化树中聚为A 和B2支，A支中有 11种单倍型，在普通群体和快长群体中均有分布，但快长群体中所 占比例较高；B支中有5 种单倍型，均分布于普通群体中。遗传多样性参数显示普通尼罗罗非鱼群体的核苷酸多样性(P)、单倍型多样 性(Hd)和平均核苷酸差异数 ()都高于快长尼罗罗非鱼群体。AMOVA分析结果显示快长和普通尼罗罗非鱼2个 群体之间的F为 一0．2000(P0．1)，表明2个群体间遗传分化不明显，且2个群体的遗传差异主要来 自群体内 (120％)。 关键词：尼罗罗非鱼；GHSR基因；5侧翼区；多态性；遗传多样性 中图分类号：S917．4 文献标志码：A 文章编号：2095—0780一(2015)01—0018—07 Sequencepolymorphism of5-flankingregionsofGHSR genesand geneticdiversityoftwopopulationsofNile tilapia(Oreochromisniloticus) WANG Chunxiao ，GAOFengying ，LU Maixin ，LIU Zhigang ，ZHU Huaping ，YE Xing (1．KeyLab ofTropicalSubtropicalFisheryResourceApplication＆Cultivation，MinsitryofAgriculture；PearlRiver FisheriesResearchInstitute，ChineseAcademyofFisherySciences，Guangzhou510380，China； 2．CollegeofFisheriesandLfie，ShanghaiOcean e ，Shanghai201306，China) Abstract：Weobtained77sequencesof5，_flankingregionsofGHSRgenesfromtwopopulations(fast—growthgroupandnormal—rgowth group)ofNiletilapia(Oreochromisniloticus)byPCRamplificationandsequencingmethod，anddetected57variationsites(12inser— ringordeletingsitesand45polymorphicsites)and16kindsofhaplotypes．HapZmightbetheoriginalhaplotype．Thereweretwo branches(AandB)inthephylogenetictreeof16kindsofhaplot