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qRT.PCR检测胃癌中miRNAs的表达
陈熙,聂玉强.
广州医学院附属广州市第一人民医院消化内科,广州市消化病重点实验室研究
背景
mi砌妊属于调节l球A或核糖核酸调节子,miRNA在转录后水平调节特定靶基因mRNA的
表达,从而参与生命过程中的一系列重要进程,甚至是肿瘤的发生。多个实验和临床分析证
明miRNA可以调节癌基因和力或抑癌基因,从而发挥促癌或抑癌作用。很多国外及国内学者
对miI斟As在肿瘤中的表达情况,及对肿瘤的发生、发展、分期、药物治疗和预后等方面
开展了相关的研究工作。但是对胃癌中miRNAs的表达情况进行系统的研究还匮乏。
我们前期工作是应用miRNA基因芯片(Illumina公司)分析7例经病理确诊为胃腺癌,以
及及同个病人距离胃癌病灶5cm以上癌旁组织的miRNA表达。包括下列步骤:提取总RNA、
RNA多聚腺苷酸化、双链cDNA合成与纯化、PCR扩增、芯片杂交及数据处理、并使用相
关的数据分析软件,比较胃癌和癌旁组织中miRNAs的表达情况,芯片结果显示有9个
hsa-miR-21·,hsa-miR-27a,hsa-miR-584,hsa-miR-93)。
目的
前期研究中已发现胃癌组织存在差异性miRNA表达谱,本研究将扩大样本量,用定量
RT-PCR验证芯片显示胃癌中高表达的4个miRNA表达情况;同时设立其他无胃癌患者且
内镜诊断为慢性浅表性胃炎(CSG)者组成对照组,对比目标miRNA在胃癌、癌旁及CSG
中表达情况;使用相关的数据分析软件预测其靶基因;为下一步研究该miRNA的靶基因
及KEGG通路与胃癌的发生、发展和预后的相关性的研究奠定基础。
方法
l、从新鲜冰冻标本库中取出50对胃癌及癌旁标本,25例CSG活检标本提取总RNA,并
逆转录成cDNA进行后续的实验。根据miRNA数据库和相关文献,查询人类miRol8la、
Green
以上的癌旁组织及CSG病人中的表达情况。
2、为了明确差异表达的miRNAs与胃癌临床病理因素的关系,将已验证的miRol81a和
miR027a的表达水平与患者年龄、性别、病理分型以及有无淋巴结转移进行了统计分析。
法均预计的靶基因作为候选靶基因;采用KEGG通路数据库分析靶基因的l汪GG通路。
结果
号秩检验显示,相对于癌旁组织,miR-181a及miR-27a在胃癌组织中均有统计学意义上的
胃炎组织,miR.18la和miR-27a在胃癌组织中为高表达(p=O.00)。
第142页
2、miR.181a和miR一27a的表达水平与胃癌患者年龄、性别、病理分型以及有无淋巴结转移
均没有统计学差异。
因分别参与了11及15个KEGG途径,包括了人类代谢途径、代谢作用、遗传信息处理、
环境信息处理、细胞进程和有机体系等分子的相互作用和反应网络。
结论
1、通过应用荧光定量RT.PCR技术证实miR-181a和miR.27a在胃癌中为高表达。
2、miR-181a和miR-27a的表达水平与患者年龄、性别、病理分型以及有无淋巴结转移均没
有统计学差异。
3、预测miR-181a和miR-27a的靶基因及KEGG通路。
5一羟色胺转运体基因启动子区多态性与肠易激综合征
常媛嫒
天津医科大学总医院300052
目的:旨在研究5.羟色胺转运体(SERT)基因多态性对SERT表达、下游基因转录的影响
并探讨与临床肠易激综合征(IBS)症候群和精神心理症状的关系。
并取健康对照120例:
的扩增,琼脂糖电泳分析5-HTrLPR多态性,并分析5-HTTLPR多态性与IBS的关系。
第二部分:应用PCR扩增包含5-HTrLPR多态性等位基冈的启动予区,应用荧光素酶
报告基因检测系统研究该启动了对下游基冈转录水平的影响和调控。
第三部分:从结肠粘膜组织中提取SERT蛋白,通过Westernblot检测SEI玎蛋白的表
膜SERT蛋F1表达最的关系。
第四部分:应用精神心理症状自评最表(SCL.90)及症状积分对所有研究对象进行研
究,并与SERT基因多态性、SERT表达、启动予功能做相关性分析。
结果:
C.IBS组L/L频率显
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