基于mtDNA序列分析青鱼群体遗传结构.pdfVIP

第45卷 第 2期 淡 水 渔 业 2015年 3月 Vo1．45 No．2 FreshwaterFisheries Mar．2015 基于 mtDNA序列分析青鱼群体遗传结构 杨宗英一，汪登强，陈大庆 ，段辛斌 ，刘绍平 1．中国水产科学研究院长江水产研究所，武汉 430223； 2．华中农业大学 水产学院，武汉 430070 摘要：分析了长江中游监利 四大家鱼原种场、石首四大家鱼原种场、长沙四大家鱼原种场、监利江段野生青鱼 MylophⅡryng0donpiceus 、鄱阳湖野生青鱼 5个群体共 160尾青鱼 的mtDNA控制区982bp片段的变异。结果显 示：该片段的变异位点有80个，其中64个为简约信息位点，l6个为单一突变位点。160个样本中共检测出57 个单倍型 ，单倍型多样性指数为0．950，平均核苷酸多样性指数为0．01242。AMOVA分析显示：群体间变异率 为3．30％，群体内的变异率为96．70％，变异主要来 自于群体内；遗传变异系数F。 0．03292，显示青鱼群体 间没有显著的遗传分化。中性检验T~imasD 一0．53182 P 0．1 ，FusFs 0．13248 P 0．1 ，长江中游青 鱼可能没有经历过种群扩张事件。 关键词：青鱼 Mylopharyngodonpiceus ；长江中游；控制区；遗传结构 ． 中图分类号：$917．4 文献标识码：A 文章编号：1000-6907一 2015 02-0003-05 GeneticstructureanalysisbasedonthemitochondrialDNA ofMylopharyngodonpiceus YANG Zong—ying，，WANG Deng—qiang ，CHEN Da—qing ，DUAN Xin—bin ，LIU Shao—ping 1．YangtzeRiverFisheriesResearchInstitute，ChineseAcademyofFisheryScience，Wuhan 430223，China； 2．CollegeofFisheries，HuazhongAgriculturalUniversity，Wuhan 430070，China Abstract：TheMylopharyngodonpiceusisoneofthefourChinesemajorcarpsandtheYangtzeRiverharborsitsmostgerm— plasm．ThemtDNAcontrolregion 982bp wasusedinthisresearchtoanalyzethegeneticvariationofthisfish n 160 collectedfrom5populations．includingthreefourChinesemajorcarpsbreedingfalrmslocatedinJianli．ShishouandChan— gsha，JianlisectionofmiddleYangtzeRiverandPoyangLake，80variablesiteswerefound，including64parsimonyin— formativesitesand16singletonvariablesites．57haplotypeswereidentified．Thehaplotypediversitywas0．950andthe averagenucleotidediversitywas0．01242． AMOVA analysissuggested thepercentagevariation among populationswas 3．30％ andwithinpopulationswas96．70％ ，thevariationmainlyexisted withinpopulations；thegeneticdifferentiation indexFsTwas0．03292，whichsuggestedthatnosignificantdifferentiationexistedamongpopulations．TajimaSDwas一 0．53182 P 0．1 ，andFuSFswas0．13248 P 0．1 ，whichindicatedthatthepopulationsof piceusinthemid— dleYangtzeRivermaynotexperiencedapopulationexpansion． Keywords：Mylopharyngodonpicens ；themiddleYangtzeRiver；D—loop；geneticstru