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PBl6 217
解螺旋酶DrRecQ功能结构域HRDCl的结构和功能研究
刘珊珊1,张雯2,明倩倩1,高增强2,侯海峰2,蓝文贤1,董宇辉2,曹春阳1
f1.中国科学院上海有机化学研究所生命有机国家重点实验室,上海200032:
2.中国科学院高能物理研究所,北京同步辐射光源,北京100049)
耐辐射球菌D.radiodurans拥有高效精确的DNA修复系统,这使它可以在强辐射环境
重要组成部分,研究表明,HRDCl在DrRecQ全长蛋白和DNA的结合中发挥了作用。我们
用核磁共振方法解析了HRDCl的溶液结构,并用荧光偏振方法测定了几个不同结构域与各
种DNA的解离常数,考察了它们在结合DNA时的作用。HRDCl的溶液结构显示其整体拆
叠和已报道的其它物种的HRDC结构域的类似。蛋白由6个a螺旋组成,图示的残基形成
疏水核心,它们之间的疏水相互作用将蛋白的构象固定。经过序列比对,发现这些残基在其
它物种的HRDC中是高度保守的。同时,我们测定了HRDCl,突变体HRDCl
K553A,
dsDNA和3-OHdsDNA(由18单链和30单链退火而成)的结合常数。结果
dsDNA.30-bp
如图所示,表明HRDCl和5种DNA的结合较弱,KD在几十“M左右,属于较弱的结合强
度。三个突变体相对HRDCl,其Ko均有所降低,说明这些残基所在位置是蛋白和DNA的
HRDCl
作用区域。RQCHRDCl和DNA显示较强的结合,在几百nM左右,并且,将RQC
HRDCl HRDCl
上HRDCl部位的残基突变后(RQCH564A,RQCR575A)蜘值几乎没有
HRDCl类似,说明N端的helicase未参与DNA的结合。
DNA的结合强度和RQC
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结合常数测定)
+通讯联系人:曹春阳:电话:021E—mail:ccao@一sioc.ac.en;
董宇辉:电话:010Email:dongvh(,ihep,at.on
218 PBl6
Structural N-terminalHRDCdomain
intothemost
insight
of helicasefromDeinococcusradiodurans
RecQ
Shanshan
Liul8,Wen Hou2,Wenxian Wul,
Zhan92吒ZengqiangGa02,QianqianMin91,Haifeng Lanl,Houming
Caok,Yuhui
Chunyang Don92*
(1.
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