肝癌易感性相关基因的文献计量学与生物信息学分析.pdfVIP

擅堕迨盘查 生 旦笪丝鲞笙 塑 旦 』垒 RPREVTREAT，February2015，Vo1．22 No．4 ·3O5· 荟《萃分析／论著l 肝癌易感性相关基因的文献计量学与生物信息学分析 上官辉 谭淑燕 张积仁 1．南方 医科大学附属佛 山医院(肿瘤 内科 ：上官辉 ；肝病科 ：谭淑燕)，广东 佛 山 528000 2．南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心，广东 广州 510282 【摘要】 目的 汇总分析肝癌易感基 因研究文献 ，并通过生物信息学方法筛选关键基 因，为进一步的研究提供参考 。方 法 检索Embase、Pubmed和 BIOSISPreview 3大文献数据库 2001-01—2014—01相关文献 ，基于文献挖掘的方法统计肝 癌易感基 因，使用生物信息学方法对于易感基 因进行分析 。结果 纳入相关文献共 708篇，研究显示近 3年论文发表增 长明显 。文献涉及 201个基 因，其 中不同分级的基 因本体论 (GeneOntology，GO)分类 741种 ，京都基因与基 因组百科全 书数据库 (KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes，KEGG)通路 66种 ，这些基 因主要与细胞损伤修复 、免疫反应 、细 胞周期调节、炎症反应、DNA损伤修复、凋亡和抗原递呈等有关。KEGG通路主要是参与细胞受体信号传导通路、细胞 周期调节、毒物降解、氨基酸和脂肪酸代谢等。在线 STRING软件构建其中189个可翻译成蛋 白的蛋 白与蛋 白相互作用 网络图，提示这些基 因的表达产物大部分存在密切的相互作用关系。进一步运用Cytoscape软件将 sTRING软件所构 建 的蛋 白网络图可视化及量化 ，筛选 出 l1个关键基 因。结论 通过对肝癌 易感基 因相关文献的文献计量学分析 ，对该 研究领域 的研究现状及发展趋势有 了系统的认识 。肝癌易感性相关基 因种类繁 多，针对关键基 因的大样本研究及 网络 化的基 因分析是未来的研究方 向。 【关键词】 肝癌 ；易感基 因；关键基 因；生物信 息学 中华肿瘤防治杂志 ，2015，22(4)：305—311 Bioinformaticsandbibliometricsanalysisofthekeyriskgenesin hepatOcellularcarcinoma SHANGGUAN Hui ，TAN Shu—yan ，ZHANGJi—ren 1．FoshanHospitalofSouthernMedicalUniversity，Foshan528000，P．R．China 2．OncologyCenter，ZhujiangHospitalofSouthernMedicalUniversity，Guangzhou510282，P．R．China [ABSTRACT] OBJE『CTIVE Todeterminethekeygenesassociatedwithhepatocellularcarcinomariskandprovideref— erenceinformationforfurtherstudy．METHODS W esearchedrelativearticlesinEmbase，PubmedandBIOSISPreview fromJanuary2001toJanuary2014．Hepatocellularcarcinomariskgenesthatwereobtainedfrom clinicalarticlesand bioinformaticsanalyseswereselected．RESULTS Totally708articlesrelatedtoriskofhepatocellularcarcinomawerein— cluded．Researchsho