弓形虫PRU 株BSR4 基因的体外扩增及生物信息学分析.pdfVIP

弓形虫PRU 株BSR4 基因的体外扩增及生物信息学分析.pdf

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蚌埠医学院学报2011年3 月第36卷第3期 217 [文章编号] 1000鄄2200(2011)03鄄0217鄄06 ·基础医学· 弓形虫PRU株 BSR4基因的体外扩增及生物信息学分析 郭摇 凯,陈兴智,焦玉萌,夏摇 惠,方摇 强,王雪梅 [摘要]目的:克隆弓形虫Prugniaud(PRU)株表面抗原BSR4基因,并进行序列测定和生物信息学分析。 方法:根据BSR4基因 已知序列(ME49株)设计合成一对引物,应用PCR技术从弓形虫PRU株基因组DNA 中扩增BSR4基因,克隆入pET28a(+) 载体并进行序列测定。 用生物信息学方法对BSR4 的理化性质、结构和功能进行预测。 结果:得到弓形虫PRU株BSR4 基因 片段,测序结果表明,获得BSR4基因片段约1194 bp,编码398个氨基酸。 同源性分析显示,弓形虫PRU株和ME49株基因序 列同源性为100%,BSR4相对分子量为42344.75,有2个功能结构域,氨基酸序列的前40位为信号肽序列。 N端为信号肽,C 端为疏水序列,预测它为糖基磷脂酰肌醇固着蛋白,存在 18个潜在抗原表位及2 个保守功能区域。 结论:成功获得弓形虫 PRU株BSR4基因序列。 [关键词] 弓形虫;BSR4基因;体外扩增;生物信息学分析 [中国图书资料分类法分类号] R382.5摇 摇 摇 [文献标识码]A Amplification and bioinformatics analysis of Toxoplasmagondii BSR4 gene GUO Kai,CHEN Xing鄄zhi,JIAOYu鄄meng,XIA Hui,FANG Qiang,WANGXue鄄mei (Department of PathogenBiology,BengbuMedical College,BengbuAnhui233030,China) [Abstract] Objective:To clone and identify the surface antigen BSR4 of Toxoplasma gondii(T.gondii) PRU strain,to match the homology of BSR4 among T.gondii PRU and ME49 strains,andto analyzethefeatureby bioinformatics.Methods:DNA of strainPRU of T.gondii was extracted,and a pair of specific primers were designed from sequence of T.gondii ME49 bradyzoite surface antigen BSR4 and used to amplify the BSR4 of T.gondiiPRU strainby PCR,then cloned intovector pET28a(+) and sequencing.Predict the physical and chemical nature,structure and function of BSR4. Results:The target gene was amplified by PCR.The sequencing result showedthat thefragmentwas1194bpwhichencoded398aminoacid.Thededuceaminoacidsequcenceof PRUstrainBSR4geneshoweda 100% homologywiththat of ME49 strain.The predicted BSR4 protein molecular weight is42 344.75 Dalton which can form two functional domainswith a signal peptide location before 40 amino acids.The N鄄terminal of BSR4 was a signal peptide and the C鄄termin

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